More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3125 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  100 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  79.64 
 
 		 280 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  77.86 
 
 		 280 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  76.07 
 
 		 280 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  73.65 
 
 		 282 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  74.01 
 
 		 282 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  73.65 
 
 		 282 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  72.2 
 
 		 286 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  73.29 
 
 		 282 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  71.84 
 
 		 286 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  71.48 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  71.84 
 
 		 286 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  72.2 
 
 		 282 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  71.27 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  70.18 
 
 		 284 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  66.91 
 
 		 285 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  53.82 
 
 		 284 aa  292  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  51.6 
 
 		 288 aa  291  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  52.73 
 
 		 285 aa  285  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  52.57 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.11 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.11 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  51.11 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.74 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  51.79 
 
 		 286 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  50.37 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.37 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.37 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.37 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.37 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  53.08 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  50.72 
 
 		 282 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  50.36 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  52.06 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  50 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.3 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  46.15 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.09 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.69 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  49.45 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  47.29 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.91 
 
 		 281 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.74 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.74 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.74 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  55.1 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  55.14 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  50.96 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.74 
 
 		 277 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.37 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.29 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.97 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  50.19 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.18 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.35 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.58 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  46.76 
 
 		 287 aa  255  5e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  51.43 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  52.36 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  46.76 
 
 		 287 aa  251  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.19 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  46.86 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  50 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  44.8 
 
 		 279 aa  241  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.79 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  51.64 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  45.15 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  43.12 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  43.01 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  42.97 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  41.31 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.94 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  42.24 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  42.61 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  41.2 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  41.94 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.91 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  42.58 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  39.49 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  41.05 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  43.75 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.75 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.53 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  42.91 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  40.27 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  39.13 
 
 		 277 aa  205  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.02 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  43.4 
 
 		 280 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  43.4 
 
 		 280 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  42.86 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  42.21 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  38.77 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.83 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  43.37 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  40.96 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  43.24 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  41.76 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.67 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  40.3 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  42.86 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>