More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0948 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  100 
 
 		 301 aa  613  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  51.88 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.88 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.88 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.88 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.88 
 
 		 277 aa  278  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.54 
 
 		 277 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.66 
 
 		 276 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.66 
 
 		 276 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.88 
 
 		 277 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.54 
 
 		 277 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  51.54 
 
 		 277 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.32 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.98 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.17 
 
 		 281 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  48.97 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  49.83 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.02 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.85 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  50.56 
 
 		 282 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.54 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.66 
 
 		 277 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  49.25 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  49.44 
 
 		 288 aa  248  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.59 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  47.59 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  45.62 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  48.15 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  42.7 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  47.39 
 
 		 284 aa  235  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  44.41 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  45.39 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  44.57 
 
 		 285 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  46.32 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  46.99 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  45.15 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  45.52 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.15 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  45.02 
 
 		 286 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  44.65 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  44.65 
 
 		 286 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  46.84 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  45.52 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  44.98 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  45.15 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  45.9 
 
 		 282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  45.9 
 
 		 282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  45.9 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  44.94 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  45.15 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.32 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  43.28 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.67 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.27 
 
 		 276 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  43.28 
 
 		 276 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  44.27 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  45.88 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  45.49 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  43.07 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  42.41 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  42.97 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  42.8 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  40.82 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  43.53 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.44 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  38.71 
 
 		 274 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  38.91 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  40.32 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  39.78 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  39.56 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  40.89 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  40.44 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.38 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  40.07 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  39.71 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  39.11 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.26 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  38.89 
 
 		 275 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  42.26 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  38.06 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  38.75 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.15 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  39.07 
 
 		 277 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  37.82 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.35 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  38.69 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  38.75 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.82 
 
 		 300 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  38.75 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  37.37 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.18 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  36.94 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  38.2 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.96 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.72 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>