More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0147 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  67.49 
 
 
283 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.45 
 
 
286 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  45.62 
 
 
286 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.99 
 
 
280 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.45 
 
 
280 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.16 
 
 
283 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.09 
 
 
280 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  45.09 
 
 
280 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  44.64 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  44.48 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  44.48 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  44.16 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  45.52 
 
 
274 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  46.72 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.55 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.15 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  45.96 
 
 
300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  47.31 
 
 
275 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  43.43 
 
 
285 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  43.43 
 
 
285 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  43.43 
 
 
285 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  44.04 
 
 
310 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  43.43 
 
 
285 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  43.43 
 
 
285 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  43.43 
 
 
285 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.97 
 
 
275 aa  208  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  43.07 
 
 
285 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  43.24 
 
 
284 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  44.02 
 
 
285 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  42.03 
 
 
282 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  43.3 
 
 
288 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  42.86 
 
 
289 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  44.49 
 
 
277 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.44 
 
 
277 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.44 
 
 
277 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.44 
 
 
277 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.44 
 
 
277 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  45.31 
 
 
277 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.46 
 
 
277 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  47.48 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  41.98 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.62 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  43.08 
 
 
294 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  44.4 
 
 
280 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  43.59 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  43.98 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  43.5 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  41.79 
 
 
284 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.27 
 
 
281 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  43.07 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.53 
 
 
277 aa  195  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  42.75 
 
 
283 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.85 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  42.69 
 
 
276 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.15 
 
 
277 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.44 
 
 
276 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  42.15 
 
 
277 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  42.42 
 
 
287 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  44.86 
 
 
276 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.76 
 
 
277 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.59 
 
 
289 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.53 
 
 
276 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  42.68 
 
 
270 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.35 
 
 
280 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  41.38 
 
 
277 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  44.44 
 
 
276 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.38 
 
 
277 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.38 
 
 
277 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  38.49 
 
 
288 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.38 
 
 
277 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.38 
 
 
277 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.53 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  42.05 
 
 
287 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.04 
 
 
283 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.54 
 
 
276 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  41.6 
 
 
289 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  42.97 
 
 
286 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.15 
 
 
276 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.33 
 
 
276 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  39.7 
 
 
285 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  42.97 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.15 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  40 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  40.61 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  41.15 
 
 
276 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  47.71 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  41.04 
 
 
279 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  40.23 
 
 
277 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  42.64 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  38.52 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  38.52 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  38.52 
 
 
282 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  41.04 
 
 
311 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  38.52 
 
 
282 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  39.18 
 
 
301 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  38.18 
 
 
284 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  39.77 
 
 
285 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  41.44 
 
 
283 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  41.7 
 
 
283 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>