More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0849 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  100 
 
 
287 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  75.18 
 
 
283 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  65 
 
 
280 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  64.66 
 
 
280 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  66.92 
 
 
283 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  63.04 
 
 
311 aa  323  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  64.93 
 
 
280 aa  316  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  61.35 
 
 
294 aa  312  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  58.25 
 
 
289 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.47 
 
 
280 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  54.34 
 
 
275 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  51.58 
 
 
274 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  49.81 
 
 
289 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  46.85 
 
 
310 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  50.37 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  46.38 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  49.64 
 
 
286 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  48.03 
 
 
270 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  48.46 
 
 
285 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  48.46 
 
 
285 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  48.46 
 
 
285 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.54 
 
 
283 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  48.12 
 
 
285 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  48.12 
 
 
285 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  48.12 
 
 
285 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  48.12 
 
 
285 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  49.44 
 
 
294 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.55 
 
 
286 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  47.44 
 
 
285 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  51.31 
 
 
276 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  45.36 
 
 
300 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.66 
 
 
276 aa  205  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.29 
 
 
285 aa  205  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  45.74 
 
 
289 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  44.4 
 
 
279 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.12 
 
 
300 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.91 
 
 
276 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.91 
 
 
276 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  44.56 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  45.7 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.23 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.8 
 
 
276 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  47.94 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.78 
 
 
280 aa  198  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  47.19 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  47.19 
 
 
283 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  49.8 
 
 
276 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  44.4 
 
 
277 aa  195  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  44.4 
 
 
277 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  49.4 
 
 
276 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.07 
 
 
275 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  40.3 
 
 
305 aa  192  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  48.01 
 
 
280 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.4 
 
 
276 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.65 
 
 
280 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.42 
 
 
280 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  47.08 
 
 
287 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  46.93 
 
 
280 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  39.71 
 
 
301 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  49.48 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  43.01 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  46.27 
 
 
277 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  47.08 
 
 
280 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  47.08 
 
 
280 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.45 
 
 
276 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  45.78 
 
 
295 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  44.64 
 
 
275 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  38.19 
 
 
308 aa  185  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  42.64 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  40.6 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  41.26 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  39.7 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.24 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  40.89 
 
 
287 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  42.7 
 
 
286 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  39.69 
 
 
279 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.23 
 
 
276 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  40.48 
 
 
285 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  41.2 
 
 
286 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  39.37 
 
 
280 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  39.18 
 
 
280 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  45.36 
 
 
281 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  41.35 
 
 
284 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  39.7 
 
 
286 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  39.7 
 
 
286 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  39.7 
 
 
286 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.54 
 
 
280 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  42.37 
 
 
285 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  39.25 
 
 
282 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  50.67 
 
 
276 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  40.52 
 
 
284 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.71 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  40.45 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  39.32 
 
 
288 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.3 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.07 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  41.07 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.57 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.57 
 
 
277 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.57 
 
 
277 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>