More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3523 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  91.61 
 
 		 286 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  59.01 
 
 		 292 aa  311  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  55.87 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.38 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  49.47 
 
 		 288 aa  251  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  46.01 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  47.46 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  43.32 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.63 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  48.33 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  47.81 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.04 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.08 
 
 		 296 aa  215  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  47.6 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.07 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  48.81 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  48.31 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  47.57 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.86 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  44.4 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  45.86 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  49.16 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  45.39 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  49.43 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  40.37 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  40.45 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.54 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  40.57 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40.62 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  38.03 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  41.37 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.09 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  37.46 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  37.72 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.86 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.71 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  38.78 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.71 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  36.46 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.34 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  37.63 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  39.51 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.62 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.3 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  37.72 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  40.52 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  39.31 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  40.68 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.92 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  38.91 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  35.69 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  39.49 
 
 		 278 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.13 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  33.56 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.25 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.32 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  38.87 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  39.49 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.45 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  36.33 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  42 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  38.57 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  39.08 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  36.65 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.41 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.46 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.35 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  40.4 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  37.41 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  37.41 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.16 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  34.74 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.79 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  39.15 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  37.79 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.17 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.64 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.49 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  38.37 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.06 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  38.52 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.67 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.3 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.4 
 
 		 276 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.43 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  35.69 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  35.34 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  39.54 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  38.85 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  42.02 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  36.63 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.99 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  35.21 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  34.95 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  39.41 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  38.78 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  38.78 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>