More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1061 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  77.01 
 
 		 276 aa  411  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  71.9 
 
 		 276 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  74.45 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  72.63 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  71.9 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  72.36 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  69.23 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  72.99 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  75.55 
 
 		 276 aa  361  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  69.23 
 
 		 277 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  57.74 
 
 		 281 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  56.82 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  55.73 
 
 		 283 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  55.47 
 
 		 281 aa  279  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  54.41 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  50.9 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  55.73 
 
 		 277 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  55.73 
 
 		 277 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  55.73 
 
 		 277 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  55.31 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  55.73 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  53.28 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.55 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.41 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  53.41 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  53.88 
 
 		 285 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  55.73 
 
 		 277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  56.06 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.03 
 
 		 277 aa  272  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.65 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  50 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.06 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  51.64 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  52.27 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.27 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.27 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.27 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.27 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.69 
 
 		 276 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  51.74 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.31 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  53.23 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  50.96 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  50.96 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  51.35 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  50.57 
 
 		 286 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  52.73 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  50.97 
 
 		 282 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  50.97 
 
 		 282 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  51.74 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  50.97 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  50.97 
 
 		 282 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  51.45 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  49.29 
 
 		 288 aa  258  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  53.75 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  55.64 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  50.19 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  49.05 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  49.42 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  53.49 
 
 		 286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  49.61 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  50.58 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.88 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  49.62 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  52.94 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  48.65 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.88 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  46.76 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  54.07 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  48.26 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  46.4 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  53.23 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  46.95 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  45.52 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  54.69 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  50 
 
 		 289 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  48.24 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.5 
 
 		 286 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.24 
 
 		 275 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  50.98 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.06 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.38 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  47.86 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  49.81 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  51.13 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  52.92 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  47.29 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  47.66 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  50 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  50 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  50 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  49.63 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  49.63 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  49.63 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  49.63 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.24 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  49.44 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  48.85 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  44.91 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>