More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  100 
 
 
276 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  96.01 
 
 
276 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  71.9 
 
 
294 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  69.31 
 
 
277 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  71.01 
 
 
276 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  71.74 
 
 
276 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  71.38 
 
 
276 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  71.74 
 
 
276 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  72.1 
 
 
276 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  70.4 
 
 
277 aa  358  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  72.1 
 
 
276 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  55.34 
 
 
282 aa  288  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  57.31 
 
 
284 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  58.2 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  56.44 
 
 
283 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  52.9 
 
 
284 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  55.94 
 
 
286 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  53.64 
 
 
286 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  54.37 
 
 
284 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  53.26 
 
 
286 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  55.56 
 
 
285 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  53.26 
 
 
286 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  55.3 
 
 
279 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.17 
 
 
277 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  54.17 
 
 
277 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.79 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.41 
 
 
277 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  53.03 
 
 
277 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.92 
 
 
277 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.92 
 
 
277 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.03 
 
 
277 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  52.51 
 
 
286 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.92 
 
 
277 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.03 
 
 
277 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.03 
 
 
277 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.92 
 
 
277 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.03 
 
 
277 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.34 
 
 
276 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  52.31 
 
 
282 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  52.31 
 
 
282 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.92 
 
 
277 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  52.31 
 
 
282 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  52.31 
 
 
282 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  50 
 
 
288 aa  268  8.999999999999999e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  49.63 
 
 
285 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  52.87 
 
 
285 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.79 
 
 
276 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.7 
 
 
281 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  54.9 
 
 
285 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  51.54 
 
 
282 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  52.36 
 
 
280 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  50 
 
 
288 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.03 
 
 
281 aa  261  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  50.19 
 
 
280 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  52.51 
 
 
280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  48.28 
 
 
279 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.12 
 
 
276 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  50.91 
 
 
274 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  52.09 
 
 
284 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.37 
 
 
276 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  54.09 
 
 
281 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50 
 
 
276 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  48.36 
 
 
298 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.03 
 
 
280 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  54.51 
 
 
295 aa  248  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  50.38 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.62 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  51.91 
 
 
286 aa  241  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.57 
 
 
281 aa  237  1e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  45.88 
 
 
287 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  45.88 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.41 
 
 
275 aa  228  9e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  44.03 
 
 
301 aa  227  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  49.02 
 
 
275 aa  224  9e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  44.4 
 
 
277 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  49.02 
 
 
270 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  44.02 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  51.53 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  50.72 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.28 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  48.64 
 
 
284 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  51.74 
 
 
283 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.52 
 
 
283 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  46.64 
 
 
283 aa  214  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  49.22 
 
 
281 aa  215  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  47.27 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  52.55 
 
 
275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  49.62 
 
 
283 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  48.69 
 
 
287 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  42.16 
 
 
314 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  45.95 
 
 
300 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.95 
 
 
300 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.99 
 
 
280 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  48.3 
 
 
285 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.23 
 
 
280 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  48.25 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.55 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  48.64 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.18 
 
 
280 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  46.13 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>