More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1279 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  100 
 
 
280 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  67.5 
 
 
280 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  66.91 
 
 
294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  67.05 
 
 
280 aa  322  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  66.91 
 
 
283 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  64.66 
 
 
287 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  66.28 
 
 
283 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  62.59 
 
 
289 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  61.96 
 
 
311 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  57.89 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  55.91 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  56.27 
 
 
280 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  52.9 
 
 
281 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.58 
 
 
285 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  53.23 
 
 
294 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  51.26 
 
 
270 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  50.18 
 
 
306 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  58.08 
 
 
276 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  53.15 
 
 
276 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  52.47 
 
 
276 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  49.64 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  55.7 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  52.63 
 
 
276 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.29 
 
 
300 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  49.12 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  49.47 
 
 
285 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  49.47 
 
 
285 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.76 
 
 
276 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  49.47 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  49.47 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  49.47 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  49.47 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  44.53 
 
 
279 aa  215  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  46.54 
 
 
277 aa  215  7e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  49.12 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  45.68 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.65 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  50.57 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.73 
 
 
275 aa  212  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  46.15 
 
 
277 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  43.73 
 
 
287 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  49.62 
 
 
276 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  49.81 
 
 
277 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  43.37 
 
 
287 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.77 
 
 
276 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  52.21 
 
 
277 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  49 
 
 
295 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  50 
 
 
286 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  47.12 
 
 
283 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.26 
 
 
283 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  49.45 
 
 
280 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  47.46 
 
 
275 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.08 
 
 
280 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.44 
 
 
286 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  44.88 
 
 
310 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  44.7 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  51.21 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.08 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  49.08 
 
 
280 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  49.08 
 
 
280 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  44.73 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.65 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  48.34 
 
 
280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  44.24 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.29 
 
 
277 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.4 
 
 
277 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  44.29 
 
 
277 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.93 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  45 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  43.85 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.04 
 
 
277 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.04 
 
 
277 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.04 
 
 
277 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.51 
 
 
276 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  47.29 
 
 
281 aa  195  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.04 
 
 
277 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.15 
 
 
281 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.93 
 
 
277 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  47.65 
 
 
287 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  41.76 
 
 
284 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.57 
 
 
277 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  43.57 
 
 
277 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.57 
 
 
277 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.57 
 
 
277 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.97 
 
 
276 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.57 
 
 
277 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  43.88 
 
 
289 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.59 
 
 
276 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  40.35 
 
 
280 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  45.26 
 
 
286 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.93 
 
 
286 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  42.91 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  43.24 
 
 
285 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  46.18 
 
 
283 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  39.65 
 
 
285 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  41.38 
 
 
282 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  41.38 
 
 
282 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.32 
 
 
276 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  41.38 
 
 
282 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  41.38 
 
 
282 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>