276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1101 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  100 
 
 
400 aa  828    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  69.67 
 
 
404 aa  556  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  69.67 
 
 
404 aa  557  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  52.04 
 
 
381 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  52.48 
 
 
409 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  51.01 
 
 
389 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  50.51 
 
 
368 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  50.51 
 
 
379 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  51.38 
 
 
380 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  51.38 
 
 
380 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  51.86 
 
 
417 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  51.41 
 
 
376 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  51.4 
 
 
378 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  51.4 
 
 
378 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  50.75 
 
 
396 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  51.4 
 
 
378 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  51.4 
 
 
378 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  50.51 
 
 
384 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  50.75 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  51.4 
 
 
378 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  51.4 
 
 
378 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  49.5 
 
 
417 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  50.38 
 
 
397 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  50.13 
 
 
377 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  50.38 
 
 
397 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  49.62 
 
 
377 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  49.87 
 
 
377 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  49.87 
 
 
377 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  51.73 
 
 
403 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  50.13 
 
 
397 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  49.11 
 
 
374 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  49.62 
 
 
392 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  48.35 
 
 
374 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  52.02 
 
 
390 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  49 
 
 
389 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  51.26 
 
 
390 aa  352  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  47.47 
 
 
425 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  47.49 
 
 
388 aa  338  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  46.86 
 
 
358 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  41.07 
 
 
378 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  40 
 
 
382 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  39.24 
 
 
414 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  40.77 
 
 
382 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  40.98 
 
 
386 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  61.45 
 
 
89 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  33.9 
 
 
227 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  26.7 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  28.49 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.05 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  26.97 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  38.89 
 
 
238 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  32.69 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  31.82 
 
 
498 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  28.03 
 
 
208 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  29.05 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  26.74 
 
 
262 aa  57  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  27.57 
 
 
188 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  31.01 
 
 
185 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  33.11 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.26 
 
 
315 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  39.33 
 
 
484 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  30.71 
 
 
208 aa  53.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  29.29 
 
 
278 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  29.24 
 
 
202 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  28.26 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  30.17 
 
 
333 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  28 
 
 
244 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  25.14 
 
 
201 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  28.26 
 
 
277 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  39.24 
 
 
480 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  30.77 
 
 
297 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.58 
 
 
276 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  41.67 
 
 
275 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.84 
 
 
308 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  39.02 
 
 
243 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  41.33 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  26.39 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  27.89 
 
 
293 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  28 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  27.17 
 
 
509 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.28 
 
 
313 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  26.39 
 
 
286 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  28.64 
 
 
285 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0685  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.17 
 
 
333 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  26.39 
 
 
286 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  26.15 
 
 
340 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.28 
 
 
313 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  32.52 
 
 
204 aa  49.7  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  23.72 
 
 
227 aa  49.7  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  32.63 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  31.31 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  30.73 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  31.58 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  29.46 
 
 
164 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  40.79 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  35.62 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  33.06 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.27 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  33.33 
 
 
231 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>