More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0129 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  55.28 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  46.43 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  44.48 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  40.36 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  35.82 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  41.26 
 
 		 283 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  41.1 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  37.15 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  38.52 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  37.83 
 
 		 280 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  38.11 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  39.25 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.53 
 
 		 280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  35.87 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  37.18 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.22 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  36.56 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  36.74 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  34.72 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.08 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  36.98 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.1 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  35.16 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  42.53 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.36 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  34.96 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  31.97 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  38.58 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  35.21 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  37.26 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  37.26 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.93 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  34.08 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 361 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  40.64 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.88 
 
 		 280 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  35.27 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  34.59 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  35.74 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.72 
 
 		 283 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  41.47 
 
 		 274 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.96 
 
 		 283 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.91 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2759  modification methylase, HemK family  43.42 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2379  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.42 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.52 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  38.24 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  39.84 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.6 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.72 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.72 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  33.72 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.72 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  33.72 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  35.14 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.71 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.08 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.83 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  33.72 
 
 		 283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  36.33 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  34.29 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  33.72 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  37.74 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  38.35 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  41.7 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  39.17 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.4 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  32.95 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  42.73 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  35.9 
 
 		 285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  38.68 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  44.25 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  32.97 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  41.18 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  36.33 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.94 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  36.03 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  39.73 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  36.74 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  37.83 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.47 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  36.74 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  36.74 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  36.74 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  36.74 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  34.56 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  39.92 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  32.85 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  36.74 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.74 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  38.91 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.29 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  31.41 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.31 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  39.02 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  36.62 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  38.94 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>