More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0068 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  100 
 
 		 283 aa  538  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  46.43 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  43.21 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  42.91 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.73 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  42.09 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  40.91 
 
 		 287 aa  161  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.82 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.52 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.28 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  38.85 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  38.16 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  44.88 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  40.29 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  39.65 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  36.67 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.01 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  48.08 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.64 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  43.6 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  40.56 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  35.45 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  40.28 
 
 		 283 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  40.89 
 
 		 275 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  44.59 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  41.3 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  29.93 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  39.68 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  41.06 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  40.43 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.15 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  40.21 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  39.44 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  32.79 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  39.33 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  40.5 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  35.93 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  38.72 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  41.2 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.49 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.85 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.71 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  40.97 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  41.18 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.01 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.54 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  40 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.77 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.24 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  28.52 
 
 		 359 aa  141  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4634  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.84 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.06 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.11 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  37.32 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  39.93 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.13 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  37.18 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.88 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  42 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  35.82 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  36.6 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  39.41 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  41.63 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  39.41 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.63 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.64 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  39.63 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  38.19 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  38.85 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.36 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  37.41 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.07 
 
 		 296 aa  135  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  38.6 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  39.16 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.26 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  42.58 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  29.87 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.21 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.21 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  40.32 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.82 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.91 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.34 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.93 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  39.7 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  40 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  32.66 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  37.72 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  33.94 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  36.98 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  28.46 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  38.85 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.8 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  32.91 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>