More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 314 aa  638    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  55.56 
 
 		 345 aa  342  5e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08890  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.21 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000459348  normal  0.752559 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  47.3 
 
 		 297 aa  282  6.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  38.26 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.51 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.84 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  38.78 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  38.19 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.14 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.06 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.02 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.33 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.99 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  38.06 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  35.39 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  37.3 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.8 
 
 		 285 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  34.94 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  33.12 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.83 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.25 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.12 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.54 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.9 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.79 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.81 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  37.18 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  35.28 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  34.7 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  36.61 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  35.83 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  31.61 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  36.24 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.43 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  31.94 
 
 		 587 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  31.61 
 
 		 587 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.05 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.74 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.53 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.83 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.11 
 
 		 300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  33.23 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  36.1 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  35.59 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.87 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.76 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.95 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  34.72 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  35.25 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.86 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.81 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.09 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  32.9 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  33.22 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  36.05 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.52 
 
 		 277 aa  138  8.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  34.72 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  34.23 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  35.19 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  35.69 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  35.76 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  35.35 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.78 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.12 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  36.71 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.59 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  35.15 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  35.19 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  30 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  28.25 
 
 		 361 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.68 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.04 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  34.89 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  32.36 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.95 
 
 		 283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  30.61 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.35 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.06 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  32.9 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  34.04 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  29.68 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  29.35 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.81 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.35 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.78 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  36.27 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  32.43 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  29.03 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  29.35 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  29.35 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.39 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.35 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  31.83 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.87 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  34.44 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  30.87 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  32.13 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  35.31 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>