More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1714 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  50.88 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  49.14 
 
 
297 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.9 
 
 
286 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  46.83 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  46.53 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  44.68 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  46.1 
 
 
284 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  45.67 
 
 
286 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.07 
 
 
286 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  45.74 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  49.41 
 
 
282 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  46.95 
 
 
297 aa  208  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.67 
 
 
288 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  41.55 
 
 
285 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  39.66 
 
 
297 aa  204  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.23 
 
 
285 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  44.88 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  42.76 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  40.75 
 
 
307 aa  199  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  46.56 
 
 
288 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.84 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.2 
 
 
296 aa  195  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  43.75 
 
 
289 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  42.07 
 
 
301 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  39.58 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.62 
 
 
297 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  48 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.25 
 
 
285 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  41 
 
 
279 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  40.96 
 
 
277 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  40.6 
 
 
295 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  42.24 
 
 
274 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.2 
 
 
287 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  40 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  39.51 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  40.07 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.07 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  40.07 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.37 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  44.53 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  39.03 
 
 
280 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  48.29 
 
 
280 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  45.42 
 
 
289 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.86 
 
 
280 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.86 
 
 
280 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  47.21 
 
 
280 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  47.21 
 
 
280 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.63 
 
 
314 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  39.34 
 
 
277 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  40.42 
 
 
289 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  44.18 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.35 
 
 
293 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.51 
 
 
280 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  37.28 
 
 
286 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  40.08 
 
 
288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.26 
 
 
301 aa  165  8e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  43.4 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.85 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.99 
 
 
283 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  40.46 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  42.8 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
295 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  44 
 
 
283 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.13 
 
 
276 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  43.02 
 
 
280 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  36.9 
 
 
295 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  40.08 
 
 
277 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  43.49 
 
 
286 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  43.4 
 
 
280 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  39.69 
 
 
275 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.74 
 
 
276 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.48 
 
 
275 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.84 
 
 
293 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  42.55 
 
 
287 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  40.68 
 
 
299 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  38.95 
 
 
292 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.92 
 
 
277 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.92 
 
 
277 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.92 
 
 
277 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  39.25 
 
 
283 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.35 
 
 
276 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.56 
 
 
277 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.92 
 
 
277 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  39.71 
 
 
279 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  41.25 
 
 
291 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  41.97 
 
 
276 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  34.92 
 
 
283 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.54 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.64 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  41.13 
 
 
325 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.76 
 
 
296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  43.7 
 
 
285 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  43.28 
 
 
294 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  40.09 
 
 
279 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  36.6 
 
 
298 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.85 
 
 
281 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  37.37 
 
 
285 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.76 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>