More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7605 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  100 
 
 		 295 aa  567  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  65.75 
 
 		 317 aa  338  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  61.99 
 
 		 291 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  62.41 
 
 		 289 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  62.15 
 
 		 298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  62.41 
 
 		 292 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  63.48 
 
 		 289 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  54.48 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  51.66 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.97 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.35 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  50.18 
 
 		 286 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.35 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.94 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  50.18 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.57 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.47 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  46.44 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  44.81 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  48.56 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  37.68 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.18 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.96 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  48.26 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  43.59 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.04 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  47.86 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  44.1 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  44.65 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  38.62 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  43.43 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  41.26 
 
 		 289 aa  185  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.73 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.32 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  38.98 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  37.72 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  39.35 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  40.79 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  44.28 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.06 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  46.39 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  42.18 
 
 		 283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  43.6 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  39.12 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  40.07 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  39.12 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  39.64 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  38.95 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  43.17 
 
 		 319 aa  168  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  44.96 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  45.63 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  41.83 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  39.47 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.85 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  45.69 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  38.91 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  40.67 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.91 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40.22 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  38.08 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.5 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  37.37 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.25 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.67 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  38.15 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  36.26 
 
 		 587 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  36.9 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  38.25 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  43.36 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  35.02 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  36.26 
 
 		 587 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  41.1 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.22 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.83 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.24 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  38.6 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.15 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  32.96 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.09 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  40.23 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  41.33 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.43 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  37.72 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  40.3 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.33 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.06 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  44.78 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  37.63 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  40 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  38.06 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1015  HemK family modification methylase  48.01 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.15 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  40.21 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.09 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  42.5 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  40.43 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.69 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  41.94 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>