More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3815 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  91.61 
 
 
286 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  58.66 
 
 
292 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  55.52 
 
 
293 aa  294  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.46 
 
 
283 aa  254  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  47.1 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  49.47 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  47.65 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.38 
 
 
289 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  42.7 
 
 
288 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  47.57 
 
 
317 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  47.67 
 
 
298 aa  215  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.71 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.24 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  48.71 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  46.44 
 
 
295 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.96 
 
 
299 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  47.6 
 
 
292 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.01 
 
 
285 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.86 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  44.36 
 
 
299 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  48.12 
 
 
291 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  48.74 
 
 
286 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  49.21 
 
 
289 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  42.54 
 
 
325 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  44.65 
 
 
283 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  40.3 
 
 
285 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  38.52 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  39.86 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.57 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40.23 
 
 
276 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.45 
 
 
296 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  36.82 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.19 
 
 
276 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.19 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  39.15 
 
 
285 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.83 
 
 
276 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.51 
 
 
285 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  37.54 
 
 
289 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  40.22 
 
 
275 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  38.02 
 
 
278 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  37.77 
 
 
279 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  39.16 
 
 
284 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  42.05 
 
 
286 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  38.29 
 
 
301 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.93 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.53 
 
 
286 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  37.02 
 
 
298 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.88 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.27 
 
 
297 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.77 
 
 
281 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  34.98 
 
 
283 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  35.96 
 
 
278 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  41.2 
 
 
280 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.69 
 
 
293 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  33.56 
 
 
302 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.41 
 
 
287 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.57 
 
 
285 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.23 
 
 
283 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  38.65 
 
 
286 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  38.77 
 
 
278 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  36.36 
 
 
301 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  38.57 
 
 
285 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  36.27 
 
 
304 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  36.75 
 
 
288 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.73 
 
 
279 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  35.59 
 
 
283 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.45 
 
 
286 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  38.73 
 
 
274 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  37.98 
 
 
280 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  37.98 
 
 
280 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.4 
 
 
276 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  38.76 
 
 
282 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  38.77 
 
 
278 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.26 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  34.88 
 
 
285 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.63 
 
 
280 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.78 
 
 
280 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.29 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.92 
 
 
283 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  41.84 
 
 
311 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  37.98 
 
 
283 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.68 
 
 
295 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  40 
 
 
280 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  37.74 
 
 
288 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  41.2 
 
 
283 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  39.54 
 
 
285 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.85 
 
 
289 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  35.29 
 
 
287 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.16 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.69 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.94 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  39.45 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  41.39 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.74 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  37.74 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  37.78 
 
 
274 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  37.36 
 
 
280 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  36.5 
 
 
280 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 
285 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>