More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0238 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  77.6 
 
 		 498 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  977    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  61.62 
 
 		 480 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  59.5 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  58 
 
 		 484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  49.08 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  46.31 
 
 		 486 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  40.11 
 
 		 549 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  43.38 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  42.98 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  43.31 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  43.97 
 
 		 509 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  38.81 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  40.23 
 
 		 572 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  39.8 
 
 		 494 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  36.99 
 
 		 549 aa  276  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  39.68 
 
 		 547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  38.89 
 
 		 498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  40.21 
 
 		 502 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  39.8 
 
 		 494 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  40.59 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  42.89 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  39.45 
 
 		 514 aa  259  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  38.58 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  38.58 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  41.39 
 
 		 498 aa  256  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  38.31 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  36.36 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  37.84 
 
 		 525 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  37.45 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  35.71 
 
 		 494 aa  216  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  37.21 
 
 		 324 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  39.23 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.51 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  29.91 
 
 		 281 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.51 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  29.45 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  36.43 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  33.92 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.5 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  36 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  34.38 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.76 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  32.24 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  32.28 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.95 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  28.62 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  29.73 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  34.38 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  32.02 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  33.75 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  35.66 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  39.47 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.44 
 
 		 288 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  40.54 
 
 		 200 aa  67  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  35.66 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  31.46 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  40.54 
 
 		 200 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.08 
 
 		 276 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.59 
 
 		 295 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.75 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  32.75 
 
 		 210 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  37.21 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  38.17 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  33.61 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  33.05 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50510  predicted protein  28.57 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  34.94 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.55 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  28.38 
 
 		 202 aa  62.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32 
 
 		 284 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  36.89 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  33.77 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  32.69 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.58 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  29.47 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.06 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  30.95 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.8 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  34.11 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  31.07 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  34.15 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  29.32 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.35 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.4 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  27.38 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  21.98 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  28.96 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  30.36 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  31.46 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  28.33 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  42.67 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.92 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  33.53 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  25.26 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.94 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  38.39 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  38.94 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  33.53 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>