More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1428 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  100 
 
 
494 aa  967    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  93.72 
 
 
494 aa  900    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  50.62 
 
 
481 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  47.05 
 
 
498 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  44.44 
 
 
509 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  45.38 
 
 
498 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  41.16 
 
 
496 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  43.54 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  43.54 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  43.09 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  43.54 
 
 
507 aa  309  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  43.11 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  41.33 
 
 
514 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  42.11 
 
 
484 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  41.61 
 
 
480 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  41.38 
 
 
522 aa  280  6e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  38.6 
 
 
494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  39.72 
 
 
490 aa  269  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  39.03 
 
 
549 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  40.45 
 
 
498 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  38.29 
 
 
486 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  39.2 
 
 
494 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  39.32 
 
 
508 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  40.17 
 
 
508 aa  229  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  37.45 
 
 
547 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  39.16 
 
 
572 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  35.31 
 
 
536 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  38.24 
 
 
525 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  38.4 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  39.29 
 
 
549 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  41.44 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.12 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  31.88 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.01 
 
 
286 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  42.67 
 
 
359 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  31.11 
 
 
210 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  35.14 
 
 
324 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  29.68 
 
 
210 aa  62  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  28.72 
 
 
201 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.58 
 
 
322 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  34.11 
 
 
317 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  33.9 
 
 
231 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  36.26 
 
 
285 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  46.58 
 
 
270 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  32.67 
 
 
363 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  49.43 
 
 
284 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  38.35 
 
 
317 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  35.38 
 
 
317 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  40.5 
 
 
223 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.26 
 
 
285 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  40.46 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  40.51 
 
 
271 aa  57.4  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0637  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.02 
 
 
308 aa  57.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.408193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  34.62 
 
 
316 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  35.56 
 
 
288 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  28.99 
 
 
324 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  31.03 
 
 
202 aa  57  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  36.43 
 
 
236 aa  57  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  30 
 
 
200 aa  57  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  32.05 
 
 
200 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  30.77 
 
 
200 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.32 
 
 
285 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  26.89 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  47.83 
 
 
283 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  38.4 
 
 
218 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  38.36 
 
 
262 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.69 
 
 
286 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  50.68 
 
 
274 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  37.63 
 
 
286 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.25 
 
 
317 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0721  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.86 
 
 
308 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45 
 
 
302 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  27.22 
 
 
206 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.75 
 
 
340 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  25.77 
 
 
198 aa  54.3  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.33 
 
 
407 aa  54.3  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  40 
 
 
288 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01259  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 
308 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2470  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.84 
 
 
294 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112991  hitchhiker  0.0000511944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.5 
 
 
289 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.71 
 
 
285 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  44.44 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  30.86 
 
 
284 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.04 
 
 
299 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1270  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.57 
 
 
308 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.34 
 
 
293 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.18 
 
 
330 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  47.3 
 
 
280 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  35.48 
 
 
286 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  43.42 
 
 
275 aa  53.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2857  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.82 
 
 
309 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  41.76 
 
 
275 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  26.36 
 
 
235 aa  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42 
 
 
293 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  31.82 
 
 
198 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1667  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.22 
 
 
294 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  41.77 
 
 
284 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  35.48 
 
 
286 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  35.58 
 
 
202 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  25.47 
 
 
202 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>