More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3467 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3467  methylase  100 
 
 
231 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  57.28 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  52.78 
 
 
218 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  51.85 
 
 
223 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  45.12 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2307  methylase  50.7 
 
 
218 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000535165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  43.87 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  43.87 
 
 
231 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  43.87 
 
 
231 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  42.65 
 
 
230 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  40.95 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  42.11 
 
 
249 aa  124  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  33.7 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  30.56 
 
 
202 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  30 
 
 
202 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  28.89 
 
 
202 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  28.89 
 
 
202 aa  95.5  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  26.56 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.52 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  31.11 
 
 
578 aa  72  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.78 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  32.57 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  34.57 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  37.04 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  32.65 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.71 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  26.04 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  26.53 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 
343 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.29 
 
 
340 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  32.95 
 
 
188 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.66 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  26.58 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  31.69 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.71 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  28.12 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  29.63 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  32.04 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  34.76 
 
 
494 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.98 
 
 
285 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  31.71 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.68 
 
 
340 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  26.58 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.03 
 
 
310 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  27.78 
 
 
284 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.4 
 
 
354 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.03 
 
 
310 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  31.45 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  26.49 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.77 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.22 
 
 
288 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1244  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.09 
 
 
302 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0378  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.31 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  29.78 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1546  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1404  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.31 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.26 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.545999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1513  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.31 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.447698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1344  modification methylase, HemK family  32.31 
 
 
310 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  28.08 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  28.08 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  28.08 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  28.08 
 
 
283 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  28.08 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1667  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.59 
 
 
294 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  29.32 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.25 
 
 
295 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  28.08 
 
 
283 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.08 
 
 
283 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.08 
 
 
283 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5342  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.41 
 
 
302 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
302 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03115  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.45 
 
 
310 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  35.34 
 
 
285 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  26.06 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  31.54 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1456  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.75 
 
 
391 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000347757  normal  0.132252 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  24.62 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  26.61 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  27.42 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2878  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.54 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123822  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.1 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1017  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.68 
 
 
303 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2052  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2167  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.91 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  33.09 
 
 
303 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  30.94 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  39.18 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  37.5 
 
 
481 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6044  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  33.09 
 
 
303 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2033  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  32.93 
 
 
486 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1435  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234011  normal  0.0952317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  31.58 
 
 
185 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1700  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.03 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.58 
 
 
302 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.3 
 
 
306 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2739  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.68 
 
 
306 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  28.67 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>