More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4295 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4295  methylase  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  54.21 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  53.74 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  53.74 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  49.77 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  50.69 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  47.71 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2307  methylase  49.34 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000535165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  46.58 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  42.11 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  41.83 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  42.27 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  33.33 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  36.76 
 
 		 185 aa  89  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  33.14 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  33.69 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  33.53 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  31.61 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  31.46 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  27.13 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  32.7 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  33.7 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  29.26 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  32.78 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  35.08 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  32.99 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  37.66 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  37.66 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  38.12 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  37.23 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.97 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  30.21 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  38.16 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  37.58 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.01 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  36.42 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.16 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  36.36 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  43.01 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.41 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.37 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  40.4 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  38.69 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  33.15 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  33.73 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  31.02 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.85 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08890  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.43 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000459348  normal  0.752559 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  38.52 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  32.56 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.03 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.58 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.41 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  33.13 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  34.33 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  36.72 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  36.09 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  34.73 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  33.87 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  26.2 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  40.94 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  33.13 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  33.91 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  33.71 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  29.73 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.93 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  35.91 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  34.07 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1388  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.37 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  34.73 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4934  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.82 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  36.42 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  31.54 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  40 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  36.94 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  34.94 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.76 
 
 		 340 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.15 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1325  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2716  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.51 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  32.17 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0303  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.1 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  41.54 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1427  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  32.89 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  36.3 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.12 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  35.44 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1809  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.82 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.3 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  39.57 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  34 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  36.95 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4350  HemK family modification methylase  36.3 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00937671  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  29.66 
 
 		 164 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1261  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.29 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0715503  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.19 
 
 		 343 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  32 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>