More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3642 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  100 
 
 		 309 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  87 
 
 		 304 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  56.14 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  57.14 
 
 		 286 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  56.93 
 
 		 291 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  51.9 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  50.87 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  54.58 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.05 
 
 		 287 aa  235  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  53.7 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  49.82 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  53.19 
 
 		 280 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  49.31 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  50.55 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  50.55 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  50.55 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.17 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  53.29 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.94 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  52.27 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  48.03 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  48.93 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  51.49 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  45.56 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  52.13 
 
 		 282 aa  205  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  47.46 
 
 		 284 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  48.33 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  51.62 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.72 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  44.59 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  44.8 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  47.18 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  40.48 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  43.21 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.64 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.67 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  45.86 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.79 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.43 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.58 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  39.86 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  34.53 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  37.59 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  36.96 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.33 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.43 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  37.45 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.49 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  37.6 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.1 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  39.84 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  33.96 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  36.3 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  37.5 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  38.89 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.25 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.45 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.72 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  38.77 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  33.1 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  32.96 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  40.7 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  38.13 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.14 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  38.2 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  38.71 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  34.25 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  37.45 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.93 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.5 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.18 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  38.93 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  39.39 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  35.22 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  34.44 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  37.82 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.58 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.63 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.92 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38.57 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  37.45 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  35.82 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  37.93 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  38.43 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  35.36 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.11 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  36.84 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  38.36 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.08 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  40.25 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.3 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  30.36 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  35.46 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.7 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4934  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.12 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.69 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  35.66 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  30.62 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  25.34 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>