More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2497 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
288 aa  570  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  51.25 
 
 
285 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  50.71 
 
 
286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.18 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  47.24 
 
 
307 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  49.83 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  49.82 
 
 
286 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.35 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  46.67 
 
 
288 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  44.41 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  44.44 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  45.63 
 
 
284 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  42.27 
 
 
297 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  45.39 
 
 
283 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  42.48 
 
 
284 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  42.25 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  48.28 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  41.31 
 
 
285 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  39.31 
 
 
285 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  43.55 
 
 
285 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.61 
 
 
295 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  42.03 
 
 
289 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.7 
 
 
285 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  48.44 
 
 
274 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  45.38 
 
 
281 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  39.22 
 
 
285 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  40.38 
 
 
279 aa  190  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.66 
 
 
285 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  39.93 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  39.86 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 
283 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.64 
 
 
287 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  39.18 
 
 
285 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  45.71 
 
 
289 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  43.12 
 
 
317 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  44.14 
 
 
270 aa  178  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  36.88 
 
 
279 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  43.8 
 
 
298 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  37.98 
 
 
289 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.92 
 
 
297 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  38.65 
 
 
284 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  45.42 
 
 
289 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  43.8 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.27 
 
 
314 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  41.98 
 
 
277 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  44.4 
 
 
289 aa  171  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  40 
 
 
285 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  37.5 
 
 
285 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  42.32 
 
 
293 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.52 
 
 
283 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.27 
 
 
276 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  41.29 
 
 
279 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.24 
 
 
275 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  42.26 
 
 
287 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  42.08 
 
 
275 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  44.07 
 
 
295 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.98 
 
 
289 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  38.32 
 
 
301 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  39.86 
 
 
281 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  41.15 
 
 
277 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  41.6 
 
 
294 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  39.86 
 
 
280 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  41.33 
 
 
295 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.7 
 
 
289 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  44.7 
 
 
284 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  43.89 
 
 
276 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.97 
 
 
280 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  36.4 
 
 
288 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  38.17 
 
 
277 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  41.11 
 
 
286 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  42.32 
 
 
292 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  42.74 
 
 
277 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  45.17 
 
 
280 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  39.33 
 
 
286 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  37.98 
 
 
282 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.73 
 
 
301 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  42.7 
 
 
286 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  41.48 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  38.08 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  40.3 
 
 
285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  39.56 
 
 
296 aa  165  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  40.73 
 
 
291 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.4 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  42.91 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  37.79 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  43.13 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.5 
 
 
283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  44.4 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  41.7 
 
 
276 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  35.5 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.93 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  44.4 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.55 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.11 
 
 
283 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.94 
 
 
276 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  35.91 
 
 
283 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  35.91 
 
 
283 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.91 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  39.18 
 
 
299 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.35 
 
 
286 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>