More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2308 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  100 
 
 
289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  73.93 
 
 
272 aa  349  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  61.84 
 
 
325 aa  315  8e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  60.55 
 
 
303 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  60.55 
 
 
303 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  60.55 
 
 
303 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  51.05 
 
 
288 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.96 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  49.82 
 
 
298 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  50.69 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.03 
 
 
314 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  48.12 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  49.29 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  47.84 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  52.07 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  51.28 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.12 
 
 
287 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  47.79 
 
 
309 aa  208  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  48.92 
 
 
286 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  45.94 
 
 
285 aa  202  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  48.56 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.07 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  46.91 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  46.52 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  46.85 
 
 
292 aa  195  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  45.64 
 
 
298 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.45 
 
 
312 aa  185  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  45 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  44.25 
 
 
285 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  47.24 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  40.55 
 
 
294 aa  178  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.62 
 
 
301 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.66 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.29 
 
 
304 aa  170  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  43.96 
 
 
296 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  41.53 
 
 
318 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  44.64 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.14 
 
 
304 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  44.44 
 
 
308 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  41.13 
 
 
285 aa  148  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  39.65 
 
 
284 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.06 
 
 
288 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.01 
 
 
288 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  36.96 
 
 
284 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.64 
 
 
307 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  39.01 
 
 
280 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  37.63 
 
 
296 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.97 
 
 
284 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  38 
 
 
314 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  39.93 
 
 
283 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  35.34 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.73 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.98 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  33.67 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.43 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  37.06 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  35.84 
 
 
308 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  37.55 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.68 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  39.08 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  35.19 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.37 
 
 
289 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  38.08 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.02 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.34 
 
 
279 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.9 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  35.25 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.48 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  35.45 
 
 
299 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  37.69 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  38.33 
 
 
293 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.19 
 
 
283 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  40.65 
 
 
336 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  33.84 
 
 
298 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  36.04 
 
 
325 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  34.53 
 
 
279 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  36.97 
 
 
293 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  35.97 
 
 
288 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  32.62 
 
 
277 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.68 
 
 
284 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.43 
 
 
276 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.75 
 
 
286 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.13 
 
 
277 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  37.46 
 
 
286 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  40.15 
 
 
275 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  34.3 
 
 
283 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.89 
 
 
297 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.81 
 
 
286 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  36.76 
 
 
274 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.22 
 
 
293 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.68 
 
 
289 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  36.27 
 
 
284 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  27.24 
 
 
361 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.13 
 
 
277 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.74 
 
 
277 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  35.34 
 
 
274 aa  122  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.74 
 
 
277 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.74 
 
 
277 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  34.15 
 
 
280 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  37.17 
 
 
274 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>