More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1651 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  100 
 
 		 280 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.36 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.48 
 
 		 287 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.19 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.8 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.4 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  42.11 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  37.8 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  40.94 
 
 		 285 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  42.09 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.61 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.16 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  41.33 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  42.65 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  37.89 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  40.89 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.03 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  38.95 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.71 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.77 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  41.49 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  37.55 
 
 		 289 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.71 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  40.28 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.63 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.36 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  40.94 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  37.96 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  35.92 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  39.62 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  43.48 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  40.35 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.36 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  42.32 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.21 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.71 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  32.99 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  36.5 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  33.69 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.75 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  31.8 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.77 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  39.33 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.16 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  37.99 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  35.06 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  40.36 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  40.56 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  35.06 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  37.45 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  33.1 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  40.22 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  33.21 
 
 		 587 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  34.39 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.74 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  32.86 
 
 		 587 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  38.13 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.56 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  34.97 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.61 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  36.86 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.41 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  38.52 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.14 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.81 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  35.77 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.89 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  38.01 
 
 		 319 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  39.19 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  35.13 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  36.46 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.81 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  35.02 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  35.24 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  41.35 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  36.78 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  38.85 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  38.21 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  32.61 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  36.71 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  36.4 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  37.45 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.97 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.62 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  29.5 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  40.93 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  35.02 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  37.82 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  36.47 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.83 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.51 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>