More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1287 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  100 
 
 
296 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  61.37 
 
 
282 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  63.99 
 
 
304 aa  295  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  55 
 
 
312 aa  254  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  55.24 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  51.25 
 
 
298 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  44.91 
 
 
294 aa  228  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  50.72 
 
 
288 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  46.76 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  48.75 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  50 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  51.85 
 
 
309 aa  215  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  48.93 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.35 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  50.36 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.64 
 
 
286 aa  212  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
304 aa  209  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  47.7 
 
 
286 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  48.81 
 
 
338 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.16 
 
 
287 aa  198  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  47.37 
 
 
292 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  48.2 
 
 
291 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  46.1 
 
 
285 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  49.82 
 
 
294 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  45.71 
 
 
288 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  46.92 
 
 
334 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  44.56 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  46.23 
 
 
280 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  44.33 
 
 
308 aa  175  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  44.64 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.71 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  44.64 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  44.64 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  41.05 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  43.01 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  37.98 
 
 
297 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.16 
 
 
287 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
272 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.16 
 
 
304 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.01 
 
 
307 aa  148  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  37.84 
 
 
284 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  41.38 
 
 
287 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.01 
 
 
288 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.86 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.31 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.45 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
283 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.19 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.27 
 
 
284 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  32.43 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  40.83 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  37.63 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  33.22 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  38.1 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  33.22 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  36.1 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.63 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  37.06 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.03 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.6 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  45.02 
 
 
273 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.62 
 
 
287 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.36 
 
 
285 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.42 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.11 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  34.02 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  41.45 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  37.61 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  37 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  35.04 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.1 
 
 
302 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  39.74 
 
 
293 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.29 
 
 
300 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.04 
 
 
295 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  37.5 
 
 
276 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  31.85 
 
 
285 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  37.23 
 
 
276 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  32.38 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.39 
 
 
276 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  31.33 
 
 
314 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  36.76 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  29.93 
 
 
289 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  30.61 
 
 
587 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03531  putative protein methyltransferase  28.47 
 
 
293 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.854566  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  38.01 
 
 
298 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  34.58 
 
 
281 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  35.89 
 
 
285 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  36.5 
 
 
288 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  30.94 
 
 
273 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  37.31 
 
 
280 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  30.27 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  36.9 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  30.58 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  36.75 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  34.21 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  37.87 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.45 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  36.12 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>