More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4749 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
295 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  72.48 
 
 
299 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  62.12 
 
 
299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  56.47 
 
 
296 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  56.3 
 
 
291 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  55.36 
 
 
296 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.82 
 
 
289 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  55.15 
 
 
298 aa  244  9e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  57.3 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  54.07 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  54.21 
 
 
286 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  53.38 
 
 
292 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  48.97 
 
 
295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  46.04 
 
 
287 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.04 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.91 
 
 
283 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  45.62 
 
 
292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  42.55 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  56.2 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.16 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  46.24 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  46.89 
 
 
287 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  50.76 
 
 
283 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  39.15 
 
 
288 aa  209  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.66 
 
 
293 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  44.48 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  42.05 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  47.45 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  45.07 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  41.24 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  50.68 
 
 
274 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  46.57 
 
 
275 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  46.06 
 
 
276 aa  191  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  43.73 
 
 
319 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  47.53 
 
 
278 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.61 
 
 
288 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  47.24 
 
 
270 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  37.79 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.43 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.43 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  41.64 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  44.96 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.73 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  46.18 
 
 
274 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.51 
 
 
279 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  46.91 
 
 
288 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  43.18 
 
 
278 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  39.86 
 
 
296 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  39.22 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  36.71 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  36.71 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  39.8 
 
 
297 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  41.83 
 
 
284 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.76 
 
 
307 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.87 
 
 
277 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.64 
 
 
284 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  42.06 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  47.66 
 
 
280 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.15 
 
 
280 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  38.36 
 
 
289 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  47.69 
 
 
285 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  47.69 
 
 
285 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  47.69 
 
 
285 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  47.69 
 
 
285 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  47.69 
 
 
285 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  47.69 
 
 
285 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  39.15 
 
 
301 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  47.69 
 
 
285 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  47.66 
 
 
280 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  41.43 
 
 
286 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  42.2 
 
 
283 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  45.77 
 
 
280 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  46.01 
 
 
291 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  38.27 
 
 
284 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  37.59 
 
 
285 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  32.73 
 
 
279 aa  166  5e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.79 
 
 
280 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.66 
 
 
280 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  44.79 
 
 
280 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  44.79 
 
 
280 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  35.23 
 
 
285 aa  165  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  46.84 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  44.27 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  44.09 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  43.45 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  47.49 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  42.64 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  37.69 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.51 
 
 
293 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  45.38 
 
 
286 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  30.8 
 
 
280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.37 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  39.21 
 
 
285 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.75 
 
 
285 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  40 
 
 
288 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.9 
 
 
276 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.36 
 
 
299 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  34.39 
 
 
285 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  46.1 
 
 
278 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>