More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5450 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  100 
 
 
293 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  74.34 
 
 
336 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  61.99 
 
 
313 aa  298  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  63 
 
 
305 aa  298  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  58.49 
 
 
258 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  61.42 
 
 
287 aa  278  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  56.39 
 
 
257 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  56.25 
 
 
258 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  58.85 
 
 
299 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  54.44 
 
 
275 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  57.59 
 
 
276 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  54.55 
 
 
281 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  58.78 
 
 
261 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  55.51 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  53.45 
 
 
273 aa  228  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  55.83 
 
 
298 aa  214  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  50 
 
 
245 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  49.8 
 
 
272 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  42.41 
 
 
264 aa  168  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  43.83 
 
 
270 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.95 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  37.87 
 
 
296 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  38 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.71 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.8 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  39.34 
 
 
338 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  39.73 
 
 
282 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.36 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  38.39 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.1 
 
 
288 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  42.86 
 
 
285 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.81 
 
 
307 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.91 
 
 
284 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  33.62 
 
 
299 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.1 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  33.18 
 
 
289 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  38 
 
 
292 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.31 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  35.02 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  39.66 
 
 
304 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  36.82 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  31.72 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.98 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.37 
 
 
289 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  35.75 
 
 
308 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  29.79 
 
 
285 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  27.91 
 
 
587 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  39.47 
 
 
300 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  27.91 
 
 
587 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 
297 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  31.31 
 
 
300 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  34.6 
 
 
288 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  38.12 
 
 
303 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  31.31 
 
 
300 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  36.44 
 
 
334 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1388  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.01 
 
 
304 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  36.21 
 
 
277 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  32.18 
 
 
289 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.81 
 
 
279 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  35.34 
 
 
277 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.45 
 
 
277 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  34.75 
 
 
297 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.01 
 
 
302 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.81 
 
 
295 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  26.71 
 
 
302 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1261  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.44 
 
 
300 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0715503  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.89 
 
 
286 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  38.12 
 
 
286 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  32.09 
 
 
302 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1325  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.78 
 
 
300 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2052  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.63 
 
 
302 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  35.06 
 
 
283 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.93 
 
 
293 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.96 
 
 
283 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.96 
 
 
283 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6044  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.63 
 
 
302 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.22 
 
 
286 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2033  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.63 
 
 
302 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  31.96 
 
 
283 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  31.96 
 
 
283 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.96 
 
 
283 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5342  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.63 
 
 
302 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  31.96 
 
 
283 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.96 
 
 
283 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  36.71 
 
 
318 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  34.06 
 
 
317 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  38.29 
 
 
272 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  38.97 
 
 
284 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  35 
 
 
296 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  33.11 
 
 
319 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  36.11 
 
 
289 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  33.16 
 
 
283 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1896  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.57 
 
 
297 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  38.61 
 
 
286 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  32.47 
 
 
294 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.6 
 
 
302 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  32.75 
 
 
314 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  33.04 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  33.06 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  26.76 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>