More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1773 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  52.19 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  51.41 
 
 		 336 aa  215  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  51.37 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  52.4 
 
 		 287 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  50 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  52.63 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  51 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  49.81 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  52.94 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  48.57 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  44.28 
 
 		 305 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  46.91 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  48.82 
 
 		 275 aa  184  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  47.15 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  40.49 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  43.66 
 
 		 298 aa  168  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  50.23 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  42.74 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  47.19 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.15 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.76 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  37.9 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.69 
 
 		 287 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  36.2 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  38.78 
 
 		 289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.13 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  35.32 
 
 		 301 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  40.98 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  38.32 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  34.89 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  36 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  39.55 
 
 		 288 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.65 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  30.99 
 
 		 587 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.09 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.57 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  30.52 
 
 		 587 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  37.55 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.11 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.41 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  39.51 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.59 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  36 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.13 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  38.16 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  41.4 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  42.05 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  35.24 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  36.15 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  38.68 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.07 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  35.84 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  40.8 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  33.07 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  38.35 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  31.65 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  38.46 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.35 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  37.32 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.19 
 
 		 299 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  34.78 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  29.61 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  39.23 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  32.81 
 
 		 287 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.31 
 
 		 304 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  29.66 
 
 		 302 aa  98.6  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.13 
 
 		 288 aa  98.6  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  35.74 
 
 		 334 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.73 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  28.37 
 
 		 361 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.6 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  34.39 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  37.77 
 
 		 308 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  38.78 
 
 		 294 aa  96.3  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  34.56 
 
 		 298 aa  95.5  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  35.34 
 
 		 289 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  37.07 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  34.21 
 
 		 317 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  37.07 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  37.07 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  36.06 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  35.41 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.07 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  40.61 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.25 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.81 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.34 
 
 		 295 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  34.63 
 
 		 295 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  33.49 
 
 		 304 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.33 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  35.68 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.58 
 
 		 304 aa  92.8  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  34.42 
 
 		 279 aa  92  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  37.33 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  38.35 
 
 		 289 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  29.26 
 
 		 279 aa  92  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  36.92 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>