More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4332 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 272 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  57.81 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  57.5 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  55.33 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  54.31 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  58.4 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  56.02 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  49.8 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  51.34 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  49.18 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  49.79 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  53.19 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  55.91 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  43.15 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  46.13 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  49.81 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  49.58 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  47.19 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  45.19 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  45.66 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.36 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.94 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  38.8 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.27 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.43 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.83 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  37.06 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.51 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  34.98 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  36.98 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.32 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  35.71 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  32.48 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  36.87 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.24 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  31.58 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  37.37 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  26.89 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  31.41 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  36.79 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  30.4 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  27.16 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  37.13 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  30.89 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.62 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  36.92 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  34.18 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  35.94 
 
 		 280 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  33.47 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.41 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  36.6 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  37.02 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  35.48 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  35.43 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  35.48 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.75 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  33.62 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  32.66 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  34.72 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  40.61 
 
 		 300 aa  92  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  35.27 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  32.97 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  35.42 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.02 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  27.13 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  36.6 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.21 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  37.17 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  37.17 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  37.17 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  31.6 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.11 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  31.02 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  30.73 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.32 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.97 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  30.12 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  36.56 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  36.62 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  32.84 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  37.14 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  37.63 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  34.89 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.82 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  34.45 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  30.17 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.17 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  28.7 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  32 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  35.71 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  30.92 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  35 
 
 		 334 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  31.51 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.56 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  27.64 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.72 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.04 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>