More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4817 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 287 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  60.92 
 
 		 336 aa  286  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  60.3 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  59.92 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  58.36 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  63.2 
 
 		 276 aa  262  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  59.63 
 
 		 275 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  59.92 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  59.92 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  54.38 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  56.81 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  51.57 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  55.3 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  56.77 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  57.69 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  52.4 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  55.71 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  43.95 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  54.01 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  48.65 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  37.34 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.51 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  39.13 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  42.16 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.39 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  39.79 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  37.79 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.24 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  41.41 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.98 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  34.27 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.62 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.71 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.91 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  37.97 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  40.53 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  42.93 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  40.99 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  37.79 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  41.45 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  40.19 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  42.45 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.67 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  45.21 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  41.59 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  34.48 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4350  HemK family modification methylase  39.9 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00937671  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  29.33 
 
 		 587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  29.33 
 
 		 587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  41.04 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  40.83 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  42.23 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.29 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  41.35 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  37.61 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  32.6 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  37.5 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.1 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.04 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.02 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.04 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  38.81 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  32.49 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  34.83 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2739  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.41 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  39.61 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  40.09 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.75 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  40.82 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  29.26 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  32.89 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.84 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2092  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.45 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  37.63 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42790  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.4 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  41.88 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.23 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.79 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1850  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.19 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  36.55 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1244  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.77 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  31.55 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  39.46 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.95 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  41.46 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  41.46 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  41.46 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1719  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.38 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3594  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.31 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2052  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.77 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  38.03 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  31.07 
 
 		 273 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6044  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.77 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2033  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.77 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72335  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.67 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23730  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.3 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.7 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.2 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>