More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1021 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  100 
 
 
277 aa  547  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  83.33 
 
 
277 aa  462  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  82.97 
 
 
277 aa  461  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  47.49 
 
 
289 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  46.27 
 
 
285 aa  222  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  47.64 
 
 
293 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  42.96 
 
 
289 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  43.12 
 
 
283 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  41.49 
 
 
283 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  43.26 
 
 
289 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.13 
 
 
283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  41.13 
 
 
283 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  41.13 
 
 
283 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  41.13 
 
 
283 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.78 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  41.13 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  40.07 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.13 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  40.43 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 
283 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  40.57 
 
 
285 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  42.6 
 
 
286 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  46.62 
 
 
282 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.6 
 
 
286 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  43.62 
 
 
285 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  40.29 
 
 
280 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  40 
 
 
283 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  42.18 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  41.3 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.16 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  40.96 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  41.92 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  40.07 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.16 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  42.21 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  40.67 
 
 
285 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  43.12 
 
 
287 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 
307 aa  168  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  38.97 
 
 
284 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  40.21 
 
 
296 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  38.38 
 
 
301 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  42.06 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.81 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  39.71 
 
 
280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  38.04 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.8 
 
 
288 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  36.79 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 
286 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.23 
 
 
297 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.72 
 
 
297 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  39.07 
 
 
295 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.25 
 
 
289 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  35.74 
 
 
297 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  34.58 
 
 
302 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  37.06 
 
 
289 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  34.52 
 
 
278 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  40.3 
 
 
295 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.11 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  42.11 
 
 
300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.03 
 
 
277 aa  155  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  39.31 
 
 
280 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.11 
 
 
300 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  39.54 
 
 
280 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  40.51 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  38.52 
 
 
292 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  36.11 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  34.75 
 
 
330 aa  152  8e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  37.82 
 
 
297 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.87 
 
 
296 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  40.36 
 
 
280 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  39.84 
 
 
311 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  41.11 
 
 
289 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.35 
 
 
286 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  33.1 
 
 
285 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  34.31 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.95 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  36.63 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  36.74 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.79 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  38.35 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.55 
 
 
313 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  35.36 
 
 
361 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.69 
 
 
279 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.64 
 
 
287 aa  145  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.93 
 
 
295 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  40 
 
 
310 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.93 
 
 
285 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  39.39 
 
 
274 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  40 
 
 
280 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1261  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.8 
 
 
300 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0715503  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  37.78 
 
 
278 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  36.79 
 
 
304 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.25 
 
 
314 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 
285 aa  141  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.59 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  34.32 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  33.81 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  34.7 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1325  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.02 
 
 
300 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>