More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2458 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  100 
 
 
282 aa  534  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  70.32 
 
 
312 aa  349  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  60.45 
 
 
296 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  57.14 
 
 
318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  61.82 
 
 
285 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  55.96 
 
 
298 aa  269  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  56.36 
 
 
288 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  58.63 
 
 
304 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  52.48 
 
 
292 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  50.36 
 
 
284 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.12 
 
 
286 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  50.36 
 
 
303 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  50.71 
 
 
338 aa  224  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  49.28 
 
 
284 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  45.74 
 
 
294 aa  219  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  51.99 
 
 
300 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  48.21 
 
 
285 aa  214  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  51.55 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.07 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  51.28 
 
 
294 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  52.36 
 
 
309 aa  208  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.52 
 
 
287 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  48.25 
 
 
288 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  50 
 
 
291 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  50 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.27 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  46.62 
 
 
286 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  48.72 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  48.55 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  48.55 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  48.55 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  44.68 
 
 
298 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  42.96 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  47.58 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  47.77 
 
 
308 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.33 
 
 
287 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.01 
 
 
314 aa  165  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  47.31 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  37.28 
 
 
297 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  39.07 
 
 
283 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  41.64 
 
 
293 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  41.82 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.65 
 
 
288 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.82 
 
 
289 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  45.96 
 
 
273 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.48 
 
 
286 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  38.68 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.15 
 
 
285 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  37.63 
 
 
308 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.12 
 
 
286 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
280 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  42.45 
 
 
286 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  36.19 
 
 
299 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  37.96 
 
 
284 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  40.29 
 
 
281 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.28 
 
 
287 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  41.63 
 
 
336 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  32.73 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  37.65 
 
 
345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.42 
 
 
284 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.5 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  33.57 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  34.05 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.73 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.96 
 
 
297 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.42 
 
 
275 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  37.63 
 
 
281 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.8 
 
 
289 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  38.52 
 
 
275 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  31.67 
 
 
285 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  31.27 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  40.53 
 
 
280 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.93 
 
 
285 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  34.05 
 
 
289 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.11 
 
 
285 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
288 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  38.14 
 
 
292 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  43 
 
 
257 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  35.21 
 
 
295 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  37.55 
 
 
317 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  36.09 
 
 
300 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.75 
 
 
285 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  36.46 
 
 
325 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.88 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  35.06 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.69 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  35.5 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  38.99 
 
 
286 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  38.06 
 
 
288 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  29.09 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  39.25 
 
 
280 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  38.63 
 
 
293 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.03 
 
 
302 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.43 
 
 
285 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  43.81 
 
 
299 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  34.75 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  35.22 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  37.77 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  38.87 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.45 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>