More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2622 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  100 
 
 		 286 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.65 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  54.04 
 
 		 317 aa  248  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  51.58 
 
 		 298 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.21 
 
 		 295 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  53.68 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  50.18 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  50.36 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  52.45 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  50 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.22 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.09 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.91 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  48.58 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  48.55 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.83 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.56 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  45.19 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  47.81 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.33 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  49.82 
 
 		 283 aa  198  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.26 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  35.36 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  45 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  44.78 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  46.55 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.8 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.3 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  45.04 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  44.01 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  33.92 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.11 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  43.43 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1015  HemK family modification methylase  53.48 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  42.01 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  41.92 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  48.03 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  38.54 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  37.28 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  38.38 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  35.77 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  42.15 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  45.86 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  46.85 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  42.01 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.03 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  43.51 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  45.19 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  41.63 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  38.73 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  38.14 
 
 		 289 aa  161  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  43.17 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  47.18 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.15 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  40.89 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  49.15 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.64 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  49.15 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.2 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  38.85 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  44.71 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  44.31 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  43.57 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  44.66 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.76 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  37.46 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2529  HemK family modification methylase  46.49 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.677433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.73 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  41.46 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  42.31 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.93 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  33.21 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  39.92 
 
 		 285 aa  148  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  40.67 
 
 		 285 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.9 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  36 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  45 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.67 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  41.67 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  35.51 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  41.64 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  41.64 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.28 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  44.44 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  40.49 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.85 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  32.79 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  42.59 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  42.59 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  42.59 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  42.59 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  42.12 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  42.59 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.31 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  42.59 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  42.22 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.92 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.19 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>