More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4338 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  100 
 
 
272 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  74.23 
 
 
289 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  65.58 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  65.48 
 
 
303 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  65.48 
 
 
303 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  65.48 
 
 
303 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  52.67 
 
 
288 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  50.72 
 
 
298 aa  238  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  51.99 
 
 
304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  52.42 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.19 
 
 
286 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.64 
 
 
314 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  48.52 
 
 
291 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.36 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  49.45 
 
 
280 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  48.03 
 
 
303 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  48.01 
 
 
338 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  47.1 
 
 
284 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  50.19 
 
 
294 aa  205  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.99 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  46.62 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  45.19 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  46.32 
 
 
284 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  45.99 
 
 
286 aa  194  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  48.38 
 
 
282 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  47.14 
 
 
285 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  45.82 
 
 
288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  46.79 
 
 
292 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.5 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.24 
 
 
312 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  46.5 
 
 
334 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  38.97 
 
 
294 aa  178  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  45.33 
 
 
300 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  44.44 
 
 
296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.67 
 
 
304 aa  159  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  38.51 
 
 
318 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.74 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  42.11 
 
 
308 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.29 
 
 
277 aa  145  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  36.29 
 
 
314 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.86 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.57 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  40.96 
 
 
285 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  40.15 
 
 
284 aa  139  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.08 
 
 
285 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.6 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  41.22 
 
 
286 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  40.26 
 
 
288 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.51 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  38.02 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  36.7 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  37.82 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  40.14 
 
 
283 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.87 
 
 
297 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.88 
 
 
285 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  39.18 
 
 
287 aa  131  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.46 
 
 
297 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.62 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.77 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.79 
 
 
288 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  39.71 
 
 
280 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.76 
 
 
284 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.56 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  35.56 
 
 
296 aa  129  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  40.08 
 
 
280 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  32.72 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.4 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  38.46 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  40.45 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  35.85 
 
 
284 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.13 
 
 
314 aa  125  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  36.61 
 
 
300 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  39.91 
 
 
301 aa  125  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  32.35 
 
 
277 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.81 
 
 
288 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  40.38 
 
 
336 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  37.55 
 
 
274 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.43 
 
 
286 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.57 
 
 
300 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.11 
 
 
277 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  36.3 
 
 
274 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.22 
 
 
284 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  36.16 
 
 
300 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  31.68 
 
 
279 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  31.94 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  37.94 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.38 
 
 
296 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.72 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.72 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.93 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.72 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  37.28 
 
 
325 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.08 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.72 
 
 
277 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  35.21 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  36.7 
 
 
274 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  31.93 
 
 
275 aa  119  7.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  27.76 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>