More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1259 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  100 
 
 
285 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  60.7 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  61.82 
 
 
282 aa  268  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  52.72 
 
 
318 aa  259  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  53.71 
 
 
288 aa  245  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  53.45 
 
 
284 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  53.43 
 
 
298 aa  238  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  51.64 
 
 
284 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  54.87 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  51.34 
 
 
292 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  49.65 
 
 
303 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  52.25 
 
 
300 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  50.72 
 
 
286 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  50.69 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.18 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.11 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  51.21 
 
 
334 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  46.95 
 
 
285 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  52.75 
 
 
294 aa  209  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  49.66 
 
 
338 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.68 
 
 
304 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  42.56 
 
 
294 aa  203  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  51.85 
 
 
309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.92 
 
 
314 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.83 
 
 
287 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  49.47 
 
 
304 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  46.04 
 
 
291 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  44.01 
 
 
308 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  45.99 
 
 
298 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  47 
 
 
280 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.22 
 
 
304 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.57 
 
 
301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  46.67 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  46.67 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  46.67 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  44.32 
 
 
325 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  47.55 
 
 
272 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  44.85 
 
 
289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.19 
 
 
287 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.97 
 
 
300 aa  142  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.01 
 
 
304 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
288 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.54 
 
 
283 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  40.07 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.14 
 
 
284 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.75 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.86 
 
 
286 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.94 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  38.4 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.83 
 
 
307 aa  132  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  37.3 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  39.57 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.97 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.29 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  36.55 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.03 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.03 
 
 
285 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  38.2 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  31.32 
 
 
279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  46.05 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  41.89 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  38.19 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.28 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  38.75 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.5 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  37.88 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.98 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  34.01 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  38.74 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  35.82 
 
 
285 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  30.8 
 
 
273 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  37.72 
 
 
274 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  37.97 
 
 
274 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.36 
 
 
286 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  36.94 
 
 
300 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  30.43 
 
 
273 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  43.35 
 
 
336 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  34.17 
 
 
279 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.52 
 
 
295 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.53 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  27.27 
 
 
587 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  27.27 
 
 
587 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  38.29 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  32.53 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  43.66 
 
 
295 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  36.86 
 
 
296 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  38.21 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  29.23 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  40.27 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  36.41 
 
 
300 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.5 
 
 
288 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  36.36 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0822  modification methylase, HemK family  35.44 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.97 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.86 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  35.71 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  39.71 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  38.21 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  37.64 
 
 
280 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>