More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 287 aa  557  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  66.78 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  58.19 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.93 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  52.33 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  52.57 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  49.64 
 
 		 291 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  47.77 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  53.41 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  50.56 
 
 		 289 aa  222  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.4 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  51.81 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  49.1 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  51.81 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  51.81 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  46.74 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  48.26 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  50 
 
 		 285 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.08 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  46.4 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  46.26 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  43.86 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  47.86 
 
 		 280 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  47.24 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  45.58 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  46.57 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  46.71 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  44.96 
 
 		 288 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  44.33 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.96 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  39.3 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  44.64 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  39.46 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  42.03 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.66 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.1 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.28 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.12 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  40 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  40.14 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  35.52 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  39.79 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.46 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  35.86 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.73 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  38.73 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  39.78 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.22 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.41 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  35.25 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  30.6 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  36.99 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.82 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  36.94 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  35.64 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  34.27 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  33.56 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.32 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  32.76 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.34 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  33.23 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  32.04 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  38.46 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  36.11 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  37.8 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  29.89 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  37.37 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.8 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  38.43 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  37.55 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  37.17 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  37.17 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.15 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  35.56 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  37.08 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  39.63 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.68 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  35.34 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  31.69 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.63 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  34.98 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  36.98 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  36.11 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.89 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  34.64 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  37.55 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  36.86 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.55 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  35.77 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  32.09 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  35.74 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.31 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  37.55 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  33.72 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.92 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  31.84 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.84 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  35 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  37.37 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>