More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1237 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 280 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  52.57 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  53.6 
 
 		 309 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  52.3 
 
 		 304 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.93 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  50.87 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.35 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  49.82 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  49.07 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  49.07 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  49.07 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  47.95 
 
 		 292 aa  198  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.47 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  52.11 
 
 		 289 aa  198  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  47.69 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  46.93 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  48.42 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  47.48 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  47.5 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  47 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  50 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  46.98 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  45.86 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  46.88 
 
 		 334 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.3 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  45.77 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.14 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  48.15 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  47.31 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.69 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.01 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  46.08 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  37.54 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  44.37 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  44.93 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.82 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  43.27 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  39.67 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  40.29 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  37.68 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.11 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.58 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  38.16 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.04 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.01 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  37.41 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.57 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.68 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.91 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  39.62 
 
 		 281 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38.91 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.27 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  33.56 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.69 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  37.27 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.01 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.21 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  32.73 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  41.11 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.35 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.93 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  32.12 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  35.96 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  29.71 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  34.19 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  38.41 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  33.83 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.92 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  38.58 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  37.88 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  38.26 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  36.58 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  30.77 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.43 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  31.05 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.08 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  33.46 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.45 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.85 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.46 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.46 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  39.7 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.46 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.46 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  33.08 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.46 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  39.26 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  31.96 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.08 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  38.43 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  38.43 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  33.57 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  35.47 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  35.63 
 
 		 289 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.66 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  31.06 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.69 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  36.1 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  37.69 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  31.42 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>