More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0287 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  51.48 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2529  HemK family modification methylase  54.18 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.677433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  46.58 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.01 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  44.87 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.21 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.01 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  45.16 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  44.8 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  44.74 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  41.52 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  45.86 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  44.81 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  44.74 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.86 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  40.98 
 
 		 279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  42.37 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  43.48 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  42.41 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  40.52 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  43.8 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  38.68 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  38.78 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  42.51 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  40.08 
 
 		 289 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.62 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.08 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.15 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.09 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  39.79 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  44.15 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  44.44 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.09 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.16 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  41.53 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  42.44 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  42.07 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  43.75 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.24 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.61 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  44.96 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  35.49 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  39.62 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.37 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  36.79 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  45.71 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  41.45 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  38.46 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  44.35 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  42.97 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.5 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.7 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  45.45 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  41 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  35.61 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.67 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.91 
 
 		 281 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  37.89 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  38.57 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.82 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  41.28 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  43.51 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.28 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.06 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  35.11 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  38.71 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  38.75 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  37.45 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  43.56 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  42.26 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.45 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  41.5 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.18 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  37.81 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.15 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.76 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.67 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  40.22 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  37.86 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.76 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  37.72 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2759  modification methylase, HemK family  44.21 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  41.58 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2379  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.21 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  41.25 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.93 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  36.21 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  42.15 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  38.22 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  33.92 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  42.28 
 
 		 280 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.93 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  38.93 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  40.89 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  35.14 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  35.38 
 
 		 284 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>