More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6147 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 288 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  66.78 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  59.44 
 
 		 298 aa  315  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  57.84 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  54.39 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  55.4 
 
 		 309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  55.4 
 
 		 291 aa  261  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  52.58 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.57 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  52.41 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  50 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  51.66 
 
 		 289 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  50 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  50.17 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  52.42 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.5 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  50.36 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  50.69 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  51.99 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  51.99 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  51.99 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  50.87 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  49.3 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  47.83 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  47.99 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  48.25 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  45.83 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  49.32 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  45.7 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.67 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  43.91 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  43.49 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  40.21 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.59 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.75 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  44.88 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.87 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  41.96 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.21 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.61 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  41.18 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.09 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.46 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.85 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  39.84 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  44.44 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.64 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  41.2 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  38.08 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  37.76 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  37.96 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  37.28 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  41.13 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.68 
 
 		 283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  37.82 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  39.64 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.92 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.91 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  39.17 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  34.95 
 
 		 289 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  37.82 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  38.99 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  36.43 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  38.66 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.92 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.46 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.29 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  41.02 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  37.89 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  39.08 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  37.88 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.07 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  37.45 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  39.64 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.04 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.49 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.18 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  34.53 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  33.21 
 
 		 277 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.96 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.38 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  38.03 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  39.6 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  39.6 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  39.6 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  39.6 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.07 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  39.6 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  40.6 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  40.6 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  39.6 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  39.26 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  32.83 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  37.31 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  38.65 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  35.99 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  39.41 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.89 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>