More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18330 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  100 
 
 		 308 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  47.14 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.38 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  48.36 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  44.22 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  45.03 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.95 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  43.33 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  43.73 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  46.08 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  40.71 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  42.33 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  42.38 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  43.49 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  38.94 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  43.33 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  44.67 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.14 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  43.67 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  44.9 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  44.76 
 
 		 294 aa  170  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  43.42 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  44.37 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  42.95 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.61 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  41.97 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  41.56 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.12 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.05 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  42.19 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  42.19 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  42.19 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  41.39 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  40 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.56 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.04 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  40 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  38.59 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  40.24 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  36.72 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.03 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  39.33 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  35.41 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  37.5 
 
 		 270 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  38.82 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.68 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.38 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  30.07 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.46 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.95 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  34.45 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  41.67 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.94 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  37.7 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.25 
 
 		 285 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.55 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  32.78 
 
 		 279 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  36.68 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  38.68 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  32.26 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.4 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  31.13 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  34.2 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.44 
 
 		 280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.3 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.23 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  35.54 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  34.44 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  35.45 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  40.29 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  30.3 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  31.23 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.33 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.72 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  36.45 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.77 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  36.17 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  41.18 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  36.69 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.65 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  36.79 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  36.56 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  31.45 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.75 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  35.1 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  31.76 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  35.51 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  31.76 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  36.3 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  32.68 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  28.15 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  28.51 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.54 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  31.03 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.11 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  31.05 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.12 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  34.57 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.67 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  31.8 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>