More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  51.07 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  48.56 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  49.64 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  47.18 
 
 
284 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.89 
 
 
312 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.66 
 
 
304 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.14 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  43.79 
 
 
294 aa  196  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  45.34 
 
 
318 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  45.32 
 
 
288 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  48.26 
 
 
285 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  45.79 
 
 
338 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  47.02 
 
 
286 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  43.79 
 
 
298 aa  178  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.25 
 
 
286 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  43.66 
 
 
285 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  43.36 
 
 
303 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  46.13 
 
 
291 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.96 
 
 
287 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  44.61 
 
 
294 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  43.77 
 
 
303 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  43.77 
 
 
303 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  41.55 
 
 
292 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  43.77 
 
 
303 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  46.18 
 
 
280 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  44.64 
 
 
309 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  44.57 
 
 
289 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  42.41 
 
 
304 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  41.87 
 
 
300 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  40.21 
 
 
298 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  40.32 
 
 
308 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.64 
 
 
314 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  41.61 
 
 
288 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  43.4 
 
 
334 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.98 
 
 
287 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  38.95 
 
 
325 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  39.74 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  40.3 
 
 
272 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  36.62 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.52 
 
 
297 aa  133  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.34 
 
 
287 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.66 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  41.63 
 
 
336 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  33.68 
 
 
289 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  41.98 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38.41 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  29.78 
 
 
587 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  34.47 
 
 
285 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  35.46 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  34.28 
 
 
280 aa  118  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.88 
 
 
289 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  35.79 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  29.41 
 
 
587 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.04 
 
 
296 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.22 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.83 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.19 
 
 
289 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  38.21 
 
 
301 aa  116  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  35.79 
 
 
280 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  35.71 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.42 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  35.78 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  38.73 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  32.52 
 
 
283 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  38.91 
 
 
295 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  32.75 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.12 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  38.67 
 
 
293 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  35.65 
 
 
299 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  33.58 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.27 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  29.1 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  43.81 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.13 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  31.1 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4934  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.8 
 
 
299 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  35.23 
 
 
280 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.49 
 
 
280 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  34.45 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  32.51 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  37.25 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  39.45 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  35.51 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  35.51 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  43.88 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  32.3 
 
 
279 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.14 
 
 
280 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  38.01 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  29.66 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  33.22 
 
 
284 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  34.4 
 
 
281 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.88 
 
 
280 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  36 
 
 
280 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.11 
 
 
285 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  37.32 
 
 
325 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  29.62 
 
 
285 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  30.93 
 
 
282 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>