More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3505 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  100 
 
 
289 aa  592  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  44.1 
 
 
297 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  42.41 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  41.32 
 
 
284 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.9 
 
 
285 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  42.66 
 
 
287 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  40.83 
 
 
284 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.91 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  37.19 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  38.25 
 
 
289 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  42.11 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.24 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.41 
 
 
288 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  43.94 
 
 
317 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  37.46 
 
 
297 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  43.54 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  44 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  42.07 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.58 
 
 
288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.04 
 
 
285 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  36.95 
 
 
297 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  38.28 
 
 
296 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.48 
 
 
289 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.36 
 
 
286 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  38.49 
 
 
307 aa  185  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  41.26 
 
 
295 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  39.86 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.44 
 
 
306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.31 
 
 
285 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  37.67 
 
 
286 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.36 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  37.08 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  38.57 
 
 
301 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.64 
 
 
284 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  43.28 
 
 
275 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  45.74 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  45.6 
 
 
289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.24 
 
 
285 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  40.28 
 
 
283 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  43.19 
 
 
319 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  41.39 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  38.95 
 
 
285 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  35.52 
 
 
295 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  39.21 
 
 
285 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  38.89 
 
 
325 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.03 
 
 
286 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  43.13 
 
 
293 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  37.98 
 
 
284 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.52 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  41.48 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.38 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  35.17 
 
 
289 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  37.54 
 
 
286 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  33.78 
 
 
302 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  42.12 
 
 
278 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.94 
 
 
299 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  37.19 
 
 
285 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  40.68 
 
 
277 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.93 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.88 
 
 
299 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.98 
 
 
288 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  39.26 
 
 
278 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  36.93 
 
 
285 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.17 
 
 
297 aa  165  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  37.37 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  35.86 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  42.96 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.12 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.83 
 
 
280 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.86 
 
 
296 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  40 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  38.79 
 
 
283 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  37.19 
 
 
277 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.41 
 
 
296 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.01 
 
 
296 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.63 
 
 
296 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  37.06 
 
 
277 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  39.08 
 
 
287 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.19 
 
 
276 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 
277 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.02 
 
 
285 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.21 
 
 
279 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  41.77 
 
 
276 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  40.17 
 
 
277 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  32.74 
 
 
587 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.53 
 
 
280 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.77 
 
 
276 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  39.08 
 
 
287 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  32.74 
 
 
587 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  37.01 
 
 
286 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  40.38 
 
 
280 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  38.43 
 
 
281 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  41.35 
 
 
276 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
280 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  41 
 
 
294 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  40.46 
 
 
280 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  40.46 
 
 
280 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  37.31 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.02 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  37.55 
 
 
276 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>