More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3708 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  96.13 
 
 		 285 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  69.47 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  63.03 
 
 		 284 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  63.25 
 
 		 286 aa  361  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  63.03 
 
 		 284 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  59.71 
 
 		 288 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  51.96 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  44.06 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  44.48 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  45.77 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  46.24 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  45.23 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  41.64 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.88 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  43.75 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  42.31 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  40.64 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  39.72 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  43.31 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.41 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.4 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.7 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  41.16 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  41.44 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  39.24 
 
 		 289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  42.57 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  41.63 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  45.53 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  39.12 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.44 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.78 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  41.4 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  45.08 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  40.07 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  39.04 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.31 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  40.07 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.15 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  44.32 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  40 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.63 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  43.63 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  36.98 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.75 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.38 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  43.46 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.54 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  42.15 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.77 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  40.86 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.55 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  43.61 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  34.55 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  44.07 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  40.98 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  43.51 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.33 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  41.38 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  40.78 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.05 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.29 
 
 		 283 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  43.85 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  40.36 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  40.89 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  40.07 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  44.4 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.91 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.15 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  41.42 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  39.86 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  42.75 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  40 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  39.12 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  42.31 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  41.83 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  35.91 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.01 
 
 		 284 aa  168  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  39.25 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  42.91 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  40.29 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  43.13 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  35.91 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  35.91 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  39.3 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  35.91 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  39.56 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.91 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  39.24 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.94 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  38.18 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  35.52 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  42.75 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  39.93 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  36.43 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.39 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.59 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  35.31 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.37 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>