More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1752 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  100 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  55.02 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  50.51 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  51.56 
 
 		 286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  49.65 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  50.53 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  46.78 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  48.97 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  51.34 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.44 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  47.78 
 
 		 284 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  50.17 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  52.48 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.96 
 
 		 287 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  51.81 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  48.66 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  48.12 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  47.08 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  47.55 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  49.32 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  47.2 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.55 
 
 		 312 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  47.26 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  43.71 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  47.29 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.25 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  48.59 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  46.85 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.56 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.36 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  46.47 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  45.32 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  45.32 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  45.32 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  39.2 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.55 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.22 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  36.68 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.7 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.45 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.72 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  43.42 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.9 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  36.99 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.01 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  35.32 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.03 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  35.23 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  37.71 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  37.05 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  41.75 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.95 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  33.45 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.37 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  33.57 
 
 		 285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  34.89 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  31.6 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  31.51 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  34.65 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  33.98 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  39.63 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  34.25 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  35.54 
 
 		 299 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  34.58 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.63 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08890  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.58 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000459348  normal  0.752559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  36.15 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  36.36 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  33.56 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  32.67 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.69 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  37.95 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  38.94 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.65 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  35.88 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  34.48 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  35.86 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.25 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  32.43 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  34.4 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  34.16 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  35.66 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  34.35 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  30.47 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  36.12 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.05 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  34.95 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  37.37 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.1 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  27.21 
 
 		 587 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  40.99 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  35.85 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.54 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  35.46 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  26.87 
 
 		 587 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  31.7 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.27 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  29.1 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>