More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0139 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
293 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1015  HemK family modification methylase  59.32 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  46.4 
 
 
325 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.68 
 
 
295 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  46.13 
 
 
295 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  47.31 
 
 
286 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  44.16 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  48.56 
 
 
274 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.18 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  45.9 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  47.94 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  44.61 
 
 
298 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  46.24 
 
 
299 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.57 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  45.9 
 
 
319 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  45.9 
 
 
292 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.71 
 
 
286 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.73 
 
 
284 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.03 
 
 
285 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.36 
 
 
299 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40 
 
 
284 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  37.81 
 
 
288 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  45.52 
 
 
289 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  41.18 
 
 
276 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  35.54 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  37.46 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.95 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.98 
 
 
296 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  42.01 
 
 
292 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  32.37 
 
 
280 aa  170  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  41.57 
 
 
296 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.99 
 
 
283 aa  168  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  45.37 
 
 
274 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.28 
 
 
296 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  37.63 
 
 
283 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  37.63 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.35 
 
 
286 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  31.65 
 
 
280 aa  163  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  41.95 
 
 
275 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  41.88 
 
 
283 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  38.63 
 
 
287 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  45.2 
 
 
291 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  43.31 
 
 
283 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  37.36 
 
 
278 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  37.63 
 
 
297 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.79 
 
 
287 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  41.7 
 
 
279 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  33.22 
 
 
279 aa  159  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.65 
 
 
285 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  40.07 
 
 
285 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  33.08 
 
 
279 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  32.71 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  37.77 
 
 
297 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  38.89 
 
 
293 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.83 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  37.23 
 
 
288 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.15 
 
 
281 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.62 
 
 
285 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.63 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  41.73 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.18 
 
 
285 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.72 
 
 
279 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.21 
 
 
293 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.73 
 
 
288 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  35.94 
 
 
289 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.8 
 
 
275 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  36.36 
 
 
298 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  35 
 
 
283 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  38.91 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  37.63 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  42.41 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  44.62 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.72 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  45.35 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  38.91 
 
 
283 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  34.04 
 
 
297 aa  146  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  35.44 
 
 
295 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  36.16 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  43.75 
 
 
276 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
276 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2529  HemK family modification methylase  46.09 
 
 
274 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.677433  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  42.41 
 
 
280 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  31.65 
 
 
587 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.24 
 
 
281 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  40.85 
 
 
284 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.72 
 
 
283 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  31.29 
 
 
587 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.83 
 
 
307 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.85 
 
 
283 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.98 
 
 
277 aa  142  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  36.96 
 
 
304 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  41 
 
 
281 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  36.56 
 
 
284 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  40.82 
 
 
278 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  42.41 
 
 
280 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  34.11 
 
 
283 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  32.82 
 
 
283 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  46.19 
 
 
276 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  39.64 
 
 
285 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>