More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4759 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  60.87 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  57.75 
 
 		 313 aa  261  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  56.02 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  54.37 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  51.16 
 
 		 258 aa  241  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  51.92 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  56 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  54.58 
 
 		 299 aa  234  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  57.43 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  55.47 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  54.12 
 
 		 258 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  52.03 
 
 		 305 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  52.19 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  53.6 
 
 		 276 aa  220  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  50 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  49.18 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  47.1 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  42.98 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  48.67 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40.45 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  39.74 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  40.81 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  38.46 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  37.56 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.6 
 
 		 287 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  41.97 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  39.62 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  44.02 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.82 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  39.92 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  39.73 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.09 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  43.28 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  36.05 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  40.45 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  35.84 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  43 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.16 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  36.7 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.81 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  40.5 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  36.87 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  40.17 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.22 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.3 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  39.6 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  35.87 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  40.3 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  34.85 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  40.93 
 
 		 308 aa  111  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  38.61 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  40.51 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  34.88 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.51 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  35.29 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  37.84 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  35.97 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  34.75 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.1 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  38.46 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.13 
 
 		 312 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  39.05 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  37.56 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  33 
 
 		 587 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  42.08 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  31.03 
 
 		 587 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  36.65 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  36.33 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  38.78 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.1 
 
 		 286 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  35.04 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.29 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.19 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  36 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  29.91 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.11 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  36.06 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  39.17 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.56 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  39.09 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  34.27 
 
 		 282 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.22 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  34.23 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  33.49 
 
 		 299 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.83 
 
 		 285 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  40.43 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  34.29 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  32.85 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  35.38 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  37.13 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.29 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  41.15 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  27.23 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  38.43 
 
 		 306 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  38.49 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  37.73 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>