More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0257 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  100 
 
 
313 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  61.99 
 
 
293 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  61.66 
 
 
336 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  58.61 
 
 
287 aa  268  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  57.75 
 
 
257 aa  265  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  58.55 
 
 
281 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  56.44 
 
 
299 aa  258  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  54.58 
 
 
258 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  55.76 
 
 
275 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  57.87 
 
 
276 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  56.52 
 
 
258 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  55.47 
 
 
305 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  57.09 
 
 
257 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  56.13 
 
 
261 aa  238  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  52.61 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  51.37 
 
 
245 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  54.35 
 
 
298 aa  203  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  49.79 
 
 
272 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  46.61 
 
 
270 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  42.32 
 
 
264 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  38.6 
 
 
287 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  37.21 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  36.74 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.75 
 
 
285 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.86 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  41.12 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  36.57 
 
 
299 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.59 
 
 
284 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.16 
 
 
314 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.87 
 
 
288 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  34.36 
 
 
338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  35.9 
 
 
289 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  41.71 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  40.43 
 
 
285 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  29.08 
 
 
273 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  40 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  35.29 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  40.1 
 
 
285 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  28.29 
 
 
273 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  37.09 
 
 
234 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  35.89 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.11 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  39.32 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.79 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.91 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  36.41 
 
 
283 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  29.24 
 
 
587 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  34.09 
 
 
301 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  38.27 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  35.06 
 
 
298 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.9 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  31.25 
 
 
587 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  40.27 
 
 
300 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  35.78 
 
 
334 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  34.36 
 
 
295 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  36.41 
 
 
288 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 
307 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  38.12 
 
 
296 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  33.86 
 
 
317 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.62 
 
 
287 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  37.82 
 
 
285 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.38 
 
 
285 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  30.19 
 
 
300 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  34.48 
 
 
297 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  38.03 
 
 
285 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  38.22 
 
 
284 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  31.84 
 
 
304 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  38.5 
 
 
280 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  30.19 
 
 
300 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  34.05 
 
 
301 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.09 
 
 
394 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  35.57 
 
 
277 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  35.57 
 
 
277 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  36.45 
 
 
282 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  35.38 
 
 
285 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.42 
 
 
289 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  34.62 
 
 
298 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  36.95 
 
 
292 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  36.49 
 
 
318 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1388  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35 
 
 
304 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  38.32 
 
 
297 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  40.39 
 
 
284 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  35.05 
 
 
277 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  34.38 
 
 
287 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.44 
 
 
295 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  31.62 
 
 
308 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  33.33 
 
 
294 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03531  putative protein methyltransferase  30.15 
 
 
293 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.854566  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  34.95 
 
 
292 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.92 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4934  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.39 
 
 
299 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4350  HemK family modification methylase  36.41 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00937671  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  31.56 
 
 
291 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  36.23 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.65 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  33.48 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.24 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  33.48 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.1 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1719  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.83 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>