More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1355 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  47.89 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  43.72 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  44.66 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  49.77 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  42.98 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  45.74 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  45.63 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  43.95 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  42.41 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  42.74 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  42.97 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  42.32 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  42.11 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  45.19 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  40.38 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  39.84 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  37.59 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  41.95 
 
 		 298 aa  141  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  34.51 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  36.95 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.98 
 
 		 287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  35.08 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  35.24 
 
 		 286 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.58 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  35.42 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  32.87 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.32 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  33.99 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  33.8 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.21 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  35.07 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.23 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.78 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  33.63 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  27.73 
 
 		 302 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  35.98 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  34.25 
 
 		 288 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.62 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  36.65 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  35.94 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  35.22 
 
 		 294 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  36.55 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  29.17 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  33.93 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  36.24 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  26.51 
 
 		 289 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  35.55 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  34.9 
 
 		 334 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  29.47 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  38.81 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  35.32 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  35.83 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  35.93 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03421  putative protein methyltransferase  26.05 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.783711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  31.75 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  33.06 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  35.48 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  33.49 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  31.84 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  36.5 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  30.13 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  33.65 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  29.57 
 
 		 314 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  30.28 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  31.51 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  31.86 
 
 		 318 aa  88.6  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  30.23 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  34.58 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  32.16 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  29.87 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  33.68 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23730  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.35 
 
 		 306 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0324  HemK family modification methylase  26.05 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.23 
 
 		 287 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  36.48 
 
 		 300 aa  86.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  30.3 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  25.49 
 
 		 275 aa  85.1  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.92 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  29.84 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  34.85 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  35.55 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.17 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  28.64 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  32.24 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  36.19 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  28.57 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.73 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  35.1 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.27 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  26.98 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  32.11 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.05 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  28.92 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  26.98 
 
 		 587 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.76 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  34.8 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.7 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>