More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6194 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 261 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  64.82 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  58.98 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  58.4 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  61.38 
 
 		 299 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  58.85 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  57.43 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  59.62 
 
 		 287 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  57.56 
 
 		 305 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  56.18 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  57.55 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  56.65 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  52.17 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  56.05 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  58.4 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  57.98 
 
 		 298 aa  215  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  46.46 
 
 		 258 aa  214  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  54.2 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  51.08 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  44.14 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.38 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.82 
 
 		 286 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40.47 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  41.06 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  41.97 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.05 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  45.15 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  41.1 
 
 		 287 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.59 
 
 		 287 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  30.98 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  40.77 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  38.89 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  41.45 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  43.27 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  37.71 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.59 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  45.73 
 
 		 309 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  38.2 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  44.79 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.42 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  39.49 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.7 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  42.13 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  31.49 
 
 		 587 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  39.29 
 
 		 296 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  41.05 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  45.74 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  31.06 
 
 		 587 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  42.4 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  39.38 
 
 		 289 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.66 
 
 		 289 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  39.22 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  45.02 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  41.67 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  42.69 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  46.86 
 
 		 304 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  37.2 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.98 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  37.33 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.37 
 
 		 304 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  38.71 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  38.46 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  36.63 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  47.45 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.69 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.65 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23730  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.37 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  40.3 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  37.73 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  40.54 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  37.67 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  35.58 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.02 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  39.52 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.97 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  41.08 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  34.22 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  39.66 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  40.18 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  33.63 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1850  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.15 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  34.22 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.82 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  41.05 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2052  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.41 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  38.21 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6044  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.41 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2033  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.41 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  42.58 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5342  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.41 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  38.43 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.9 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.4 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  33.06 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  37.39 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2040  modification methylase, HemK family  39.15 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219593  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  31.91 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  37.75 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  35.75 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1244  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.7 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>