More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  100 
 
 		 275 aa  527  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  56.6 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  54.44 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  55.76 
 
 		 313 aa  257  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  59.63 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  55.51 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  55.67 
 
 		 281 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  54.32 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  51.92 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  56.42 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  47.49 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  55.91 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  49.81 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  56.18 
 
 		 261 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  55.25 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  52.03 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  48.82 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  55.46 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  41.06 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  43.56 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.75 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  42.86 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.22 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  35.37 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  36.65 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  44.5 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  34.36 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.16 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  36.14 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  33.94 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.7 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  39.5 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.44 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  33.46 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  36.87 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  36.43 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  38.34 
 
 		 234 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.07 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  34.44 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  32.7 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  39.24 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  37.13 
 
 		 338 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  33.79 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.05 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  34.43 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  37.27 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  34.84 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.04 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  36.68 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  34.93 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  36 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  28.57 
 
 		 587 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  30.99 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  38.57 
 
 		 304 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.39 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  34.01 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38 
 
 		 301 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  29.09 
 
 		 587 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  38.86 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  36.8 
 
 		 334 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  37.14 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  38.29 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  36.02 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.36 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  30.62 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  31.33 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  35.89 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  34.74 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  25.89 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4350  HemK family modification methylase  38.92 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00937671  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  33.33 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  31.11 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.31 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.44 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  36.97 
 
 		 317 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.17 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2040  modification methylase, HemK family  36.45 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.02 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.4 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  32.21 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  34.88 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.68 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  32.21 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  36.72 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.11 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1850  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.96 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.02 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2092  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.65 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.09 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  28.71 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  33.64 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  32.16 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  38.1 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.16 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42790  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.96 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03421  putative protein methyltransferase  28.22 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.783711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>