More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4861 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 276 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  61.33 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  62.85 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  57.58 
 
 		 293 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  58.04 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  57.36 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  53.21 
 
 		 305 aa  244  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  55.91 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  49.01 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  51.82 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  53.52 
 
 		 257 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  54.22 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  56.75 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  57.14 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  52.94 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  52.8 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  56.22 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  53.19 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  44.66 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  46.84 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  40.87 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  41.45 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.38 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  31.96 
 
 		 587 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  31.96 
 
 		 587 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  42.65 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  36.41 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.91 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  41.33 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.54 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  40.11 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  36.25 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  36.1 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.62 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  41.18 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.16 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  37.81 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  37.74 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  41.33 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  35.57 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  37.62 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  39.5 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.9 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  37.44 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.54 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  34.72 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  39.9 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  39.29 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.41 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  35.27 
 
 		 234 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  32.14 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  41.75 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.35 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  38.71 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  38.32 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.7 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  39.17 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  29.2 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.89 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1546  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.24 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  34.78 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4350  HemK family modification methylase  39.81 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00937671  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.76 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  31.63 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  36.62 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.5 
 
 		 302 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.8 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  38.19 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1244  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.68 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  32.18 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.86 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  36.14 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  36.84 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5342  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.18 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  32.18 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  40.39 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2052  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.68 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  30.66 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  40.39 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  33.47 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6044  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.68 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  40.39 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.55 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  36.56 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  34.48 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2033  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.68 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72335  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  34.98 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1667  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.63 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03421  putative protein methyltransferase  29.33 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.783711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  38.76 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2467  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.92 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.466168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  32.58 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1326  modification methylase, HemK family  31.88 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.695473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2487  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.88 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0920216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2482  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.88 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1850  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.13 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  27.94 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2708  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.88 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>